MATLAB 以外のサンプル分位点と推定信頼区間を返す組み込み関数を探しています(MATLABecdf
はこれを行います)。
Rにはこれが組み込まれていると思いますが、まだ見つけていません。
これを行うためのスタンドアロン コードがある場合は、ここでそれを参照することもできますが、より大きなオープン コード ベースの一部として含まれているものを見つけたいと考えています。
-MATLAB から離れようとしています。
MATLAB 以外のサンプル分位点と推定信頼区間を返す組み込み関数を探しています(MATLABecdf
はこれを行います)。
Rにはこれが組み込まれていると思いますが、まだ見つけていません。
これを行うためのスタンドアロン コードがある場合は、ここでそれを参照することもできますが、より大きなオープン コード ベースの一部として含まれているものを見つけたいと考えています。
-MATLAB から離れようとしています。
このsurvfit
関数を使用して、信頼区間で生存関数を取得できます。これは単なる 1-ecdf であるため、分位数の間には直接的な関係があります。これを使用するには、各観測が完全である (打ち切られていない) ことを示す変数を作成する必要があります。
library(survival)
x <- rexp(10)
ev <- rep(1, length(x))
sf <- survfit(Surv(x,ev)~1)
出力あり:
>summary(sf)
Call: survfit(formula = Surv(x, ev) ~ 1)
time n.risk n.event survival std.err lower 95% CI upper 95% CI
-1.4143 10 1 0.9 0.0949 0.7320 1.000
-1.1229 9 1 0.8 0.1265 0.5868 1.000
-0.9396 8 1 0.7 0.1449 0.4665 1.000
-0.4413 7 1 0.6 0.1549 0.3617 0.995
-0.2408 6 1 0.5 0.1581 0.2690 0.929
-0.1698 5 1 0.4 0.1549 0.1872 0.855
0.0613 4 1 0.3 0.1449 0.1164 0.773
0.1983 3 1 0.2 0.1265 0.0579 0.691
0.5199 2 1 0.1 0.0949 0.0156 0.642
0.8067 1 1 0.0 NaN NA NA
実際、survfit
中央値とその信頼区間は計算しますが、他の分位数は計算しません。
>sf
Call: survfit(formula = Surv(x, ev) ~ 1)
records n.max n.start events median 0.95LCL 0.95UCL
10.000 10.000 10.000 10.000 -0.205 -0.940 NA
中央値の信頼区間の計算の実際の作業は、survival:::survmean
関数にうまく隠されているため、おそらく他の分位数に一般化するために使用できます。