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biomod2Rのパッケージを使用して、いくつかの種分布モデルに適合させようとしています.

biomod2エラーをスローする MaxEnt を除くすべての手法を使用して、モデルにうまく適合するように、必要なすべてのデータをコンパイルしました。

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
In addition: Warning messages:
1: running command 'java -mx512m -jar C:/Users/ajb273/inSync Share/PhD/Data/SDMs R/maxent.jar environmentallayers="Bushcrow/models/BushcrowFirstModeling/m_38411293/Back_swd.csv" samplesfile="Bushcrow/models/BushcrowFirstModeling/m_38411293/Sp_swd.csv" projectionlayers="Bushcrow/models/BushcrowFirstModeling/m_38411293/Predictions/Pred_swd.csv" outputdirectory="Bushcrow/models/BushcrowFirstModeling/Bushcrow_PA1_RUN10_MAXENT_outputs" outputformat=logistic  redoifexists visible=FALSE linear=TRUE quadratic=TRUE product=TRUE threshold=TRUE hinge=TRUE lq2lqptthreshold=80 l2lqthreshold=10 hingethreshold=15 beta_threshold=-1 beta_categorical=-1 beta_lqp=-1 beta_hinge=-1 defaultprevalence=0.5 autorun nowarnings notooltips noaddsamplestobackground' had status 1 
2: In file(file, "rt") :
   cannot open file 'Bushcrow/models/BushcrowFirstModeling/Bushcrow_PA1_RUN10_MAXENT_outputs/Bushcrow_PA1_RUN10_Pred_swd.csv': No such file or directory

biomod2これは、MaxEnt または Java を見つけることができなかったことが原因である可能性があると考えましたが、パッケージをロードし、同じ R セッションでパッケージrJava内の MaxEnt を実行しようとしましたが、正常に動作しました。dismo

何が起こっているのか誰にも分かりませんか？

ありがとう、アンドリュー

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興味のあるユーザーに知らせるために、ついにこれを解決しました。in は、ファイルへのファイル パスにスペースを入れないように思われMaxEntます。ファイルをスペースなしで別のディレクトリに移動したところ、実行されるようになりました。biomod2maxent.jar

于 2016-03-01T14:44:20.147 に答える