CTP バージョンでは、以下のコードを記述して、書式設定を使用してファイルへの変更を保存していました。RTM で何が変更されたのか分かりますか?
IEnumerable<IFormattingRule> rules = FormattingRules.GetDefaultRules("C#");
File.WriteAllText(
filePath,
modifiedTree.Format(FormattingOptions.GetDefaultOptions(), rules).GetFormattedRoot().ToFullString());