1

Python Pandas で Split-Apply-Combine パラダイムを利用しようとすると、いくつかの奇妙な動作に気付きました - 変数xが正しい長さになりません!

私が達成しようとしていることの概要:

  1. groupby() 操作を使用して、複数の会社のデータを含むデータフレームをグループに分割します (会社ごとに 1 つ)。
  2. 各グループの情報余剰を計算する
  3. 結果を含む新しいデータフレームを返す

最初のグループの計算は完璧です。ただし、2番目のグループでは、データフレームをスライスするときに前の変数の長さを継承しているようです-これはなぜですか? コードと提供されたデバッグからわかるように、私は問題を特定しようとしましたが、それを見ることができません。

関数呼び出し:

data_nasdaq_top_100_preprocessed_mi_res = sentisignal.split_apply_combine(data_nasdaq_top_100_preprocessed_merge, 'SYMBOL', sentisignal.information_surplus, 10, 'PCA_SENTIMENT', 'PCA_FINANCE', -1, True)

デバッグ (および問題):

最初のグループ:

['AAL'] exante  True
len(df.index) 928
shift_x length 928
len(x.index) 927 len(x) 927 end_index 927
len(x) 927
doane 927
success

2 番目のグループ:

['AAPL'] exante  True
len(df.index) 1006
shift_x length 1006
len(x.index) 78 len(x) 78 end_index 1005
len(x) 78
doane 78
success

これが問題です - 何らかの理由で の長さxが 78 に減り (1005 になるはずです!)、不思議なことに 1006 - 928 = 78 (最初のグループの長さ - 2 番目のグループの長さ)

コード:

分割適用結合方法

def split_apply_combine(df, key, func, *args):
# print "args:", args
return df.groupby(key).apply(func, *args)

情報余剰方式(デバッグあり)

def information_surplus(df, time_shift, varx, vary, bins, exante):
print df.SYMBOL.unique(), "exante ", exante

output = []

if exante:
    shift_range = range(0, -(time_shift+1), -1)
else:
    shift_range = range(0, time_shift+1)

print "len(df.index)", len(df.index)

for i in shift_range:
    if abs(i) > len(df.index):
        break

    shift_x = df[varx].shift(i)
    print "shift_x length", len(shift_x)

    if exante:
        end_index = (len(shift_x.index) - 1 - abs(i))
        x = shift_x.ix[1:end_index]
        y = df[vary].ix[1:end_index]
        print "len(x.index)", len(x.index), "len(x)", len(x), "end_index", end_index
    else:
        print "exec"
        x = shift_x.ix[1+abs(i):]
        y = df[vary].ix[1+abs(i):]

    mi = calc_mutual_information(x, y, bins)

    if i == 0:
        mi_origin = mi

    if mi_origin == 0: 
        inf_surp_pct = 0
    else:
        inf_surp_pct = (mi - mi_origin) / mi_origin * 100

    output.append({'SHIFT': i, 'MUTUAL_INFORMATION': mi, 'INFORMATION_SURPLUS_DIFF': mi - mi_origin, 'INFORMATION_SURPLUS_PCT': inf_surp_pct})

output_frame = pd.DataFrame(output)
return output_frame

相互情報法

def calc_mutual_information(x, y, bins):
print "len(x)", len(x)

try:
    if bins == -1:
        bins = doane_bin(x)
    if bins == np.inf:
        bins = sturges_bin(x)
except ValueError:
    bins = 10.0
# print "bins", bins
try:
    c_xy = np.histogram2d(x, y, bins)[0]
    mi = metrics.mutual_info_score(None, None, contingency=c_xy)
    print "success"
except Exception,e: 
    print "error with mi calc", str(e)
    mi = 0
return mi
4

1 に答える 1

0

これはうまくいきました:

なしで使用できるように情報余剰を.ix更新し、質問のタイトルを更新してこれを反映させ、説明付きの回答を喜んで受け入れます!

更新された方法:

def information_surplus(df, time_shift, varx, vary, bins, exante):
print df.SYMBOL.unique(), "exante ", exante

output = []

if exante:
    shift_range = range(0, -(time_shift+1), -1)
else:
    shift_range = range(0, time_shift+1)

# print "len(df.index)", len(df.index)

for i in shift_range:
    if abs(i) > len(df.index):
        break

    shift_x = df[varx].shift(i)
    # print "shift_x length", len(shift_x)

    mi = 0.0

    if exante:
        end_index = (len(shift_x.index) - 1 - abs(i))
        x = shift_x[1:end_index]
        y = df[vary][1:end_index]
        # print "len(x.index)", len(x.index), "len(x)", len(x), "end_index", end_index
    else:
        # print "exec"
        x = shift_x.ix[1+abs(i):]
        y = df[vary].ix[1+abs(i):]

    mi = calc_mutual_information(x, y, bins)

    if i == 0:
        mi_origin = mi

    if mi_origin == 0: 
        inf_surp_pct = 0
    else:
        inf_surp_pct = (mi - mi_origin) / mi_origin * 100

    output.append({'SHIFT': i, 'MUTUAL_INFORMATION': mi, 'INFORMATION_SURPLUS_DIFF': mi - mi_origin, 'INFORMATION_SURPLUS_PCT': inf_surp_pct})

output_frame = pd.DataFrame(output)
return output_frame
于 2016-03-15T21:46:03.827 に答える