R でパッケージ pvclust を使用してクラスター分析を行いました。結果のクラスター コンポーネントをコマンド「pvpick」で抽出し、8 つのクラスターのリストを作成しました。
[[1]]
[1] "sco.plu" "tra.myo"
[[2]]
[1] "sya.pap" "syn.foe" "syn.int"
[[3]]
[1] "par.bra" "sya.mic"
[[4]]
[1] "bal.cap" "spa.axi"
[[5]]
[1] "achi.lin" "gin.cir" "gym.vic" "tha.nat"
[[6]]
[1] "alb.vul" "car.bar" "cha.fab" "cyn.vor" "eut.all" "fis.tab" "hae.aur" "hae.ste" "pol.vir" "sel.cru" "spa.fro"
[12] "tri.letp" "ula.lef"
[[7]]
[1] "aux.roc" "car.cry" "car.hip" "car.lat" "clo.chr" "cyn.jam" "ech.nau" "ech.neu" "elo.sau" "hae.par" "hae.plu" "lut.syn"
[13] "lyc.bat" "ocy.chr" "oli.pal" "opi.ogl" "ort.rub" "rac.can" "rhi.por" "sco.bra" "sco.cav" "sco.reg"
[[8]]
[1] "aca.qua" "aca.bah" "aca.chi" "alu.mon" "ani.vir" "arc.rho" "asp.lun" "bag.bag" "bag.mar" "cal.cal" "cal.pen" "cal.pnt"
[13] "can.pul" "cat.spi" "cen.par" "cha.str" "chi.spi" "con.nob" "cyn.lei" "cyn.mic" "dac.vol" "dec.pun" "dia.aur" "epi.ads"
[25] "gen.lut" "gen.mac" "het.cru" "hol.cil" "hol.ads" "lac.tri" "lar.bre" "lut.ana" "lut.joc" "mic.fur" "not.gra" "pri.are"
[37] "pri.pun" "sci.pro" "sel.vom" "sel.bro"
次の分析では、クラスタ パッケージの「cuttree」関数を使用したときに得られるような「名前付きベクトル」をこのリストから作成する必要があります。各種の名前 (つまり、「sco.plu」) を名前として使用します。ベクトル内の対応するクラスター番号を使用します。それは次のようになります。
> memb_average
aca.qua aca.bah aca.chi achi.lin alb.vul alu.mon ani.vir arc.rho asp.lun aux.roc bag.bag bag.mar bal.cap cal.cal
1 1 1 2 3 1 1 1 1 4 1 1 1 1
cal.pen cal.pnt can.pul car.bar car.cry car.hip car.lat cat.spi cen.par cha.fab cha.str chi.spi clo.chr con.nob
1 1 1 3 4 4 4 1 1 4 1 1 4 1
cyn.jam cyn.lei cyn.mic cyn.vor dac.vol dec.pun dia.aur ech.nau ech.neu elo.sau epi.ads eug.bra eut.all fis.tab
5 6 6 3 5 1 1 4 4 5 1 1 4 3
gen.lut gen.mac gin.cir gym.vic hae.aur hae.par hae.plu hae.ste het.cru hol.cil hol.ads lac.tri lar.bre lut.ana
6 6 7 2 4 4 4 4 2 1 1 1 6 1
lut.joc lut.syn lyc.bat mic.fur not.gra ocy.chr oli.pal opi.ogl ort.rub par.bra pol.vir pri.are pri.pun rac.can
1 4 4 1 6 4 5 4 5 1 6 1 5 4
rhi.por sci.pro sco.bra sco.cav sco.reg sco.plu sel.cru sel.vom sel.bro spa.axi spa.fro sya.mic sya.pap syn.foe
4 4 4 4 4 2 4 5 5 3 3 1 2 2
syn.int tha.nat tra.myo tri.letp ula.lef
2 2 2 4 3
しかし、私はそうする方法を見つけるのに本当に苦労しており、非常にシンプルでエレガントな解決策があるかもしれないと再び感じています.