私は最近、研究用の主要なコーディングを行っているバイオ専攻です。研究を支援するため、キャンパスには研究者用のスーパーコンピュータがキャンパス内に設置されています。私はこのスーパーコンピューターからリモートで作業しており、Linux シェルを使用してアクセスし、ジョブを送信しています。私は、Mauve というコンピューターにインストールされたプログラムを使用して、多数のゲノムを整列させるためのジョブ送信スクリプトを作成しています。今、私は以前に Mauve でジョブを実行したことがあり、そのジョブのスクリプトをこのジョブに合うように変更しました。今回だけ、このエラーが発生し続けます
Storing raw sequence at
/scratch/addiseg/Elizabethkingia_clonalframe/rawseq16360.000
Sequence loaded successfully.
GCA_000689515.1_E27107v1_PRJEB5243_genomic.fna 4032057 base pairs.
Storing raw sequence at
/scratch/addiseg/Elizabethkingia_clonalframe/rawseq16360.001
Sequence loaded successfully.
e.anophelisGCA_000496055.1_NUH11_genomic.fna 4091484 base pairs.
Caught signal 11
Cleaning up and exiting!
Temporary files deleted.
したがって、これをトラブルシューティングする方法がわかりません。これが非常に基本的で時間を浪費している場合は申し訳ありませんが、リモート サイトでこれをトラブルシューティングする方法がわかりません。私がこれまで見てきた考えられる解決策はすべて、私が制御できないハードウェアまたはソフトウェアにアクセスする必要があります。私の現在の提出スクリプトはこれです。
module load mauve
progressiveMauve --output=8elizabethkingia-alignment.etc.xmfa --output-guide-tree=8.elizabethkingia-alignment.etc.tree --backbone-output=8.elizabethkingia-alignment.etc.backbone --island-gap-size=100 e.anophelisGCA_000331815.1_ASM33181v1_genomicR26.fna GCA_000689515.1_E27107v1_PRJEB5243_genomic.fna e.anophelisGCA_000496055.1_NUH11_genomic.fna GCA_001596175.1_ASM159617v1_genomicsrr3240400.fna e.meningoseptica502GCA_000447375.1_C874_spades_genomic.fna e.meningoGCA_000367325.1_ASM36732v1_genomicatcc13253.fna e.anophelisGCA_001050935.1_ASM105093v1_genomicPW2809.fna e.anophelisGCA_000495935.1_NUHP1_genomic.fna