data.table で動作し、パッケージ testthat を使用してテストする必要があるパッケージを作成しています。コマンド ラインから呼び出すとコードは正常に動作しますが、テスト ケースから呼び出すと問題が発生します。テストの実行時に、ベース パッケージの [] 関数、つまり data.frames の関数が使用されているようです。
ここにある最小限の例を作成しました: https://github.com/utalo/test_datatable_testthat
パッケージには単一の機能が含まれています。
test <- function() {
dt <- data.table(MESSAGE="Test 1234567890",TYPE="ERROR")
dt[,.(MESSAGE=strwrap(MESSAGE,width = 10)),by=.(TYPE)]
}
test.datatable.testthat:::test()
コマンドラインから呼び出すと、期待される結果が得られます。
TYPE MESSAGE
1: ERROR Test
2: ERROR 1234567890
ただし、次の単体テストを実行する場合:
test_that("Test package",{
dt <- test()
expected_res <- structure(list(TYPE = c("ERROR", "ERROR"),
MESSAGE = c("Test","1234567890")),
row.names = c(NA, -2L), class = c("data.table","data.frame"),
.Names = c("TYPE", "MESSAGE"))
expect_equal(dt,expected_res)
})
エラーが発生します:
1
1. Error: Test package -------------------------------------------------------------------------------------------------------
could not find function "."
1: withCallingHandlers(eval(code, new_test_environment), error = capture_calls, message = function(c) invokeRestart("muffleMessage"))
2: eval(code, new_test_environment)
3: eval(expr, envir, enclos)
4: test() at test.R:4
5: dt[, .(MESSAGE = strwrap(MESSAGE, width = 10)), by = .(TYPE)] at test.datatable.testthat/R/hello.R:5
6: `[.data.table`(dt, , .(MESSAGE = strwrap(MESSAGE, width = 10)), by = .(TYPE)) at C:\Users\D057806\Documents\R\test.datatable.testthat/R/hello.R:5
7: `[.data.frame`(x, i, j)
ご覧のとおり、テスト内で data.frame の [] が呼び出されます。私の最初の推測は、data.table パッケージへの依存関係が正しく宣言されていないということでした。これは私の記述ファイルです:
Package: test.datatable.testthat
Type: Package
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1
Date: 2016-04-07
Authors@R: person("First", "Last", email = "first.last@example.com", role = c("aut", "cre"))
Description: More about what it does (maybe more than one line)
License: What license is it under?
LazyData: TRUE
Depends:
data.table
Suggests:
testthat
RoxygenNote: 5.0.1
Using data.table package inside my own packageによると、依存パッケージとして data.table を宣言するだけで十分です。ただし、ここではそうではないようです。
testthat のコンテキストではなく、直接呼び出されたときに関数が機能する理由についての手がかりはありますか?