Visual Studio 2015 を Update 2 に更新しました。プロジェクトをコンパイルするたびに、.NET ネイティブ コンパイラが動作しなくなりました。(空のアプリではうまく機能します)。
STARTPROCESSSTASK : エラー : 内部コンパイラ エラー
error : メソッド 'A(object)' は、メソッド 'B' がないため、常に例外をスローします。アセンブリが欠落している可能性があります。
エラー: ILT0005: 'C:\Program Files (x86)\MSBuild\Microsoft.NetNative\x86\ilc\Tools\nutc_driver.exe @"C:\Projects\x86\Release\ilc\intermediate\MDIL\App5.rsp" ' 終了コード -1073741819 を返しました
一部のアセンブリが欠落しているのは事実ですが、レガシーなものがたくさんあり、それらのアセンブリを取得できません。Update 2 コンパイラがエラーではなく警告を表示する前は、アプリは問題なく実行されていました。