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geoalchemy2 の ORM に問題があります (と思います)。私のモデルは次のように定義されています。

class Location(Model):
    point = Column(Geometry('POINT', dimension=3, srid=4326))

後で次のように挿入します。

location = Location(point=WKTElement('POINT(65.567 32.95 1156.7)', 4326))
session.add(location)
session.commit()

これにより、次のエラーが発生します。

Geometry has Z dimension but column does not.
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