クラスター化されたセルの写真で流域セグメンテーションを実行しました。十分にセグメント化されていない、またはまったくセグメント化されていない細胞のクラスターが多数あるようです。過剰にセグメント化された単一セルもあります。過剰にセグメント化された単一セルをマージし、さらにセグメント化されていないセルのクラスターを分割するには、どのような方法を使用できますか?
編集: セルがセグメント化されているかどうかを判断する基準は、セルの領域が通常サイズのセルの特定の平均範囲内にあるかどうかを判断することによって行われます。これが良いアイデアかどうかはわかりません。どんな助けでも感謝します、ありがとう。
エラーをゼロにして、すべてを完璧にセグメント化することは期待できません。小さい細胞または大きい細胞を持っている可能性があります。画質が悪かったのかもしれません。
セルが特定の範囲の面積を持っていることがわかっている場合は、推定された面積が平均して以前の知識と一致するまで、集水域パラメーター (しきい値) を調整します。
非常に大きなセグメント (大面積、平均面積の 2 倍以上など) がある場合は、より高いしきい値を使用して流域をローカルで再度実行します。
ローカルに非常に小さいセグメントがある場合は、より小さなしきい値で流域をローカルで再度実行します。
半自動セグメンテーションを備えたilastikなどの別のアルゴリズムを使用する以外は、これ以上のことはしません。