Jupyter Notebookに R 用のbioconductor rain パッケージをインストールしたいと考えています。
上記のリンク先の Web サイト (R Jupiter ノートブック) の指示に従って、このパッケージを Jupyter ノートブックにインストールできません。
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rain")
次のエラーが表示されます。
Warning message:
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘gmp’ had non-zero exit statusWarning message:
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘rain’ had non-zero exit status
コマンドラインで次を使用して、 Jupyter( DESeq2 )に別のバイオコンダクターパッケージをインストールできました。
conda install bioconductor-deseq2
しかし、deseq2 とは異なり、雨は anaconda クラウド上にないため、この方法は rain パッケージでは機能しません。
Jupyter の anaconda クラウド (rain パッケージなど) にないバイオコンダクター パッケージをインストールすることは可能ですか?
ありがとうございました!