キャッシュされた静的ファイル（.css、.jsなど）をユーザーに強制的に更新させるために、一部のサイト（stackoverflow.comなど）はファイルの最後にクエリ文字列を追加しているようです。例えば：
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://sstatic.net/stackoverflow/all.css?v=9ea1a272f146">
これは良い考えだと思いますし、これも始めたいと思っています。ただし、クエリ文字列が存在する場合、プロキシがファイルを適切にキャッシュしないなどの欠点があると聞きました。
このタイプのバージョン管理の欠点は何ですか？