昨日Eclipse Neonをインストールしましたが、問題なく動作しているようです。いくつかのプラグインをインストールし、いくつかの作業を行いました。
今日、起動すると、次のエラーメッセージが表示されます。
$ /usr/local/bin/eclipse46
/root/.p2/pool/plugins/org.eclipse.equinox.launcher.gtk.linux.x86_64_1.1.400.v20160518-1444: cannot open shared object file: Permission denied
config.iniファイルにrootフォルダーへの参照がいくつか見つかりました（理由はわかりません）。これらを修正したところ、ファイルは次のようになりました。
#This configuration file was written by: org.eclipse.oomph.p2.internal.core.AgentImpl
#Tue Jul 26 16:10:00 CEST 2016
org.eclipse.update.reconcile=false
eclipse.p2.profile=_opt_eclipse.neon_eclipse
osgi.instance.area.default=@user.home/workspace
osgi.framework=file\:plugins/org.eclipse.osgi_3.10.102.v20160118-1700.jar
equinox.use.ds=true
eclipse.buildId=4.6.0.I20160606-1100
osgi.bundles=reference\:file\:org.eclipse.equinox.simpleconfigurator_1.1.200.v20160504-1450.jar@1\:start
org.eclipse.equinox.simpleconfigurator.configUrl=file\:org.eclipse.equinox.simpleconfigurator/bundles.info
eclipse.product=org.eclipse.platform.ide
osgi.splashPath=platform\:/base/plugins/org.eclipse.platform
osgi.framework.extensions=reference\:file\:org.eclipse.osgi.compatibility.state_1.0.200.v20160504-1419.jar,reference\:file\:org.eclipse.wst.jsdt.nashorn.extension_1.0.0.v201605131737.jar
osgi.bundles.defaultStartLevel=4
eclipse.p2.data.area=@config.dir/../p2/
eclipse.application=org.eclipse.ui.ide.workbench
ただし、まだ「許可が拒否されました」というエラーが表示されます。これを修正する方法はありますか？