次のユーザー定義関数を使用して分類を行うために mlr パッケージを使用しようとしていますclasFunc
。を使用して関数を呼び出すとき
clasFunc("classif.lda")
というエラーメッセージが表示されます
model.frame.default(Terms, newdata, na.action = na.pass, xlev = object$xlevels) のエラー: 因子 col1 に新しいレベル 'new level' があります
コードを使用してトレーニングデータとテストデータの要素をマージすることで、それを修正しようとしました
for(j in 1: ncol(train)){
if(class(train[,j])=="factor"){
lvls= union(levels(train[,j]), levels(test[,j]))
levels(train[,j]) =lvls
levels(test[,j]) =lvls
}
}
しかし、うまくいかないようです。
makeTask での警告 (type = type、data = data、weights = weights、blocking = blocks、: 列の空の因子レベルが削除されました: col1、col2、col3、col4、col5
これが私の完全なコードです。
clasFunc = function(clsnam){
try(
for( i in 1:5){
print(paste0("fold ", i))
train = read.csv(file =paste0("D:\\arff_csv_folds\\real_original\\train", i,".csv"))
test = read.csv(file =paste0("D:\\arff_csv_folds\\real_original\\test", i,".csv"))
for(j in 1: ncol(train)){
if(class(train[,j])=="factor"){
lvls= union(levels(train[,j]), levels(test[,j]))
levels(train[,j]) =lvls
levels(train[,j]) =lvls
}
}
trainTask <- makeClassifTask(data = train,target = "cls", positive = "yes")
testTask <- makeClassifTask(data = test, target = "cls", positive = "yes")
Clslearn = makeLearner(clsnam, predict.type = "prob")
trained <- train(Clslearn, trainTask)
predicted <- predict(trained, testTask)
print(paste0(clsnam, " fold ", i," test auc:",auc(predicted$data$truth, predicted$data$prob.yes)))
}
)
}
ここに完全な出力があります
[1]「折り1」
makeTask での警告 (type = type、data = data、weights = weights、blocking = blocks、: 列の空の因子レベルが削除されました: col1、col2、col3、col4、col5
[1] 「classif.lda フォールド 1 テスト auc:0.673604162894944」
[1]「たたむ2」
makeTask での警告 (type = type、data = data、weights = weights、blocking = blocks、: 列の空の因子レベルが削除されました: col1、col2、col3、col4、col5
[1] 「classif.lda フォールド 2 テスト auc:0.686717528654292」
[1]「三つ折り」
makeTask での警告 (type = type、data = data、weights = weights、blocking = blocks、: 列の空の因子レベルが削除されました: col1、col2、col3、col4、col5
タイミング停止: 0 0 0
model.frame.default(Terms, newdata, na.action = na.pass, xlev = object$xlevels) のエラー: 因子 col1 に新しいレベル 'new level' があります
どうすればこれを修正できますか?