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最近、R-2.11.1からR-2.12.0をインストールし、次の方法ですべてのCRANパッケージを更新しました。

update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)

ここで、R-forgeからインストールしたすべてのパッケージを更新したいのですが、CRANで利用できない場合に限ります。言い換えれば、私は単純に実行することはできません：

update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE, repos="http://r-forge.r-project.org")

survivalR-2.12.0に付属のバージョンよりもR-forgeバージョンのパッケージがインストールされるためです。

old.packagesとの情報を組み合わせて、packageStatusR-forgeにのみ存在するパッケージを特定することもできますが、カスタムソリューションを構築する前に、もっと簡単な方法があるかどうかを尋ねたいと思いました。

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これはどう：

# 1. Get the list of packages you have installed, 
#    use priority to exclude base and recommended packages.
#    that may have been distributed with R.
pkgList <- installed.packages(priority='NA')[,'Package']

# 2. Find out which packages are on CRAN and R-Forge.  Because
#    of R-Forge build capacity is currently limiting the number of
#    binaries available, it is queried for source packages only.
CRANpkgs <- available.packages(
  contriburl=contrib.url('http://cran.r-project.org'))[,'Package']
forgePkgs <- available.packages(
  contriburl=contrib.url('http://r-forge.r-project.org', type='source')
)[,'Package']

# 3. Calculate the set of packages which are installed on your machine,
#    not on CRAN but also present on R-Force.
pkgsToUp <- intersect(setdiff(pkgList, CRANpkgs), forgePkgs)

# 4. Update the packages, using oldPkgs to restrict the list considered.
update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE,
  repos="http://r-forge.r-project.org",
  oldPkgs=pkgsToUp)

# 5. Profit?
于 2010-10-19T22:46:15.343 に答える