プロセスがマシンをクラッシュさせないようにするために、Linux システムでのメモリ使用量を制限しようとしてsetrlimit
います (バグが 100 GiB を超えるメモリ消費につながったため、私のコードは高性能クラスターのノードをクラッシュさせていました) )。に渡す正しいリソースが見つからないようですsetrlimit
。setrlimit で制限できない常駐であるべきだと思いますが、常駐、ヒープ、スタックで混乱しています。以下のコードでは; のみコメントを外すと、その配列は 80 MB しかないはずなのにRLIMIT_AS
、コードはMemoryError
at で失敗します。、、または両方の配列numpy.ones(shape=(1000, 1000, 10), dtype="f8")
のみのコメントを外すと、合計メモリ使用量が 2 GB、または目的の最大値の 2 倍であっても、正常に割り当てられます。RLIMIT_DATA
RLIMIT_RSS
RLIMIT_STACK
RAM の割り当てが多すぎるとすぐに、プログラムが失敗するようにしたいと考えています。RLIMIT_DATA
、RLIMIT_RSS
、RLIMIT_STACK
およびのどれも私が意味することをしないのはなぜですか?RLIMIT_AS
に渡す正しいリソースは何setrlimit
ですか?
$ cat mwe.py
#!/usr/bin/env python3.5
import resource
import numpy
#rsrc = resource.RLIMIT_AS
#rsrc = resource.RLIMIT_DATA
#rsrc = resource.RLIMIT_RSS
#rsrc = resource.RLIMIT_STACK
soft, hard = resource.getrlimit(rsrc)
print("Limit starts as:", soft, hard)
resource.setrlimit(rsrc, (1e9, 1e9))
soft, hard = resource.getrlimit(rsrc)
print("Limit is now:", soft, hard)
print("Allocating 80 KB, should certainly work")
M1 = numpy.arange(100*100, dtype="u8")
print("Allocating 80 MB, should work")
M2 = numpy.arange(1000*1000*10, dtype="u8")
print("Allocating 2 GB, should fail")
M3 = numpy.arange(1000*1000*250, dtype="u8")
input("Still here…")
RLIMIT_AS
行のコメントを外して出力します。
$ ./mwe.py
Limit starts as: -1 -1
Limit is now: 1000000000 -1
Allocating 80 KB, should certainly work
Allocating 80 MB, should work
Traceback (most recent call last):
File "./mwe.py", line 22, in <module>
M2 = numpy.arange(1000*1000*10, dtype="u8")
MemoryError
他のコメントを外して実行した場合の出力:
$ ./mwe.py
Limit starts as: -1 -1
Limit is now: 1000000000 -1
Allocating 80 KB, should certainly work
Allocating 80 MB, should work
Allocating 2 GB, should fail
Still here…
最後の行でtop
、プロセスが 379 GB VIRT、2.0 GB RES を使用していると報告しています。
システムの詳細:
$ uname -a
Linux host.somewhere.ac.uk 2.6.32-573.3.1.el6.x86_64 #1 SMP Mon Aug 10 09:44:54 EDT 2015 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
$ cat /etc/redhat-release
Red Hat Enterprise Linux Server release 6.7 (Santiago)
$ free -h
total used free shared buffers cached
Mem: 2.0T 1.9T 37G 1.6G 3.4G 1.8T
-/+ buffers/cache: 88G 1.9T
Swap: 464G 4.8M 464G
$ python3.5 --version
Python 3.5.0
$ python3.5 -c "import numpy; print(numpy.__version__)"
1.11.1