答えが明らかな場合は申し訳ありませんが、mgcv.gam でカスタム リンク関数を使用するのにかなりの時間を費やしました。
要するに、
- パッケージpsyphyから変更された probit リンクを使用したい (使用したいpsyphy.probit_2asym、私はそれを呼び出します
custom_link
) このリンクを使用して {stats} family オブジェクトを作成し、それを glm の「family」引数で使用できます。
m <- glm(y~x, family=binomial(link=custom_link), ... )
{mgcv}gam の引数として使用すると動作しません
m <- gam(y~s(x), family=binomial(link=custom_link), ... )
エラーが発生します
Error in fix.family.link.family(family) : link not recognised
このエラーの理由はわかりません。標準を指定すると、glm と gam の両方が機能しますlink=probit
。
したがって、私の質問は次のように要約できます。
glm では機能するが gam では機能しないこのカスタム リンクには何が欠けていますか?
私が何をすべきかについてのヒントを教えていただければ、事前に感謝します。
リンク機能
probit.2asym <- function(g, lam) {
if ((g < 0 ) || (g > 1))
stop("g must in (0, 1)")
if ((lam < 0) || (lam > 1))
stop("lam outside (0, 1)")
linkfun <- function(mu) {
mu <- pmin(mu, 1 - (lam + .Machine$double.eps))
mu <- pmax(mu, g + .Machine$double.eps)
qnorm((mu - g)/(1 - g - lam))
}
linkinv <- function(eta) {
g + (1 - g - lam) *
pnorm(eta)
}
mu.eta <- function(eta) {
(1 - g - lam) * dnorm(eta) }
valideta <- function(eta) TRUE
link <- paste("probit.2asym(", g, ", ", lam, ")", sep = "")
structure(list(linkfun = linkfun, linkinv = linkinv,
mu.eta = mu.eta, valideta = valideta, name = link),
class = "link-glm")
}