はじめに、具体的な問題はないと思いますが、これらを管理するシステムがないのは奇妙に感じます。
現在、ディレクトリの階層に大量の XML ファイルがあります。これらのフォルダーの周りにドキュメント指向の DB を使用すると便利だと思います。検索目的には非常に役立つ可能性がありますが、現在、検索の必要はありません。
現在、データベースを使用する実際のビジネス上の理由を考えるのに苦労しています。「システムを高速化する」機会を提供してくれるかもしれませんが、スケーラビリティが問題になるとは思えません。
他に考慮していないことはありますか?