rmarkdown
チャンク引数を使用して、ドキュメントに図を並べて出力できますfig.show='hold'
。別のオプションは、関数ggplot2
の代わりにプロットを作成するために使用することです。cars
scatterplot
以下に両方のアプローチを示します。
ドキュメント内の並列cars::scatterplot
プロットrmarkdown
以下は PDF 出力の例です。とout.width='3in'
に関係なく、出力ドキュメントの各プロットの実際のサイズを設定します。ただし、縦横比とプロット エリアに対するテキスト サイズを調整および調整することはできます。fig.height
fig.width
fig.height
fig.width
---
title: "Untitled"
author: "eipi10"
date: "November 23, 2016"
output: pdf_document
---
```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
```{r fig.show='hold', out.width='3in', fig.height=5, fig.width=5}
library(car)
scatterplot(Sepal.Length~Sepal.Width|Species,data=iris,grid="FALSE",
boxplots="", reg.line="FALSE", pch=c(0,1,2))
scatterplot(Petal.Width~Sepal.Width|Species,data=iris,grid="FALSE",
boxplots="", reg.line="FALSE", pch=c(0,1,2))
```
を使用した並列散布図ggplot2
進んで使用する場合ggplot2
は、比較的簡単に 2 プロット レイアウトを取得できます。
library(ggplot2)
library(gridExtra)
theme_set(theme_bw())
grid.arrange(
ggplot(iris, aes(Sepal.Width, Sepal.Length, colour=Species)) +
geom_point() +
geom_smooth(alpha=0.2) +
theme(legend.position="top"),
ggplot(iris, aes(Sepal.Width, Petal.Width, colour=Species)) +
geom_point() +
geom_smooth(alpha=0.2) +
theme(legend.position="top"),
ncol=2)
出力ggplot2
のように見えるようにプロットをカスタマイズするcars::scatterplot
他の方法で上記のコードをカスタマイズできます。信頼帯が必要ない場合は、 に追加se=FALSE
しgeom_smooth
ます。種ごとに異なる形状が必要な場合は、 に追加aes(shape=Species)
しgeom_point
ます。ベースグラフィックスで使用される特定の形状が必要な場合は+ scale_shape_manual(values=0:2)
、 などを追加します。少し余分な作業を行うと、単一の凡例を取得することもできます。
以下のコードでは、元のベース グラフィック プロットに近いものを再現するために、これらのカスタマイズやその他のカスタマイズを追加しました。
# Components we'll reuse for both plots
my_theme = list(geom_point(aes(shape=Species)),
geom_smooth(se=FALSE, show.legend=FALSE, lwd=0.8),
scale_shape_manual(values=0:2),
scale_colour_manual(values=c("black", "red","green")),
theme_bw(),
theme(panel.grid.major=element_blank(),
panel.grid.minor=element_blank(),
legend.position="top"))
p1 = ggplot(iris, aes(Sepal.Width, Sepal.Length, colour=Species)) +
my_theme +
labs(x="Sepal Width", y="Sepal Length") +
scale_y_continuous(limits=c(3,8)) +
scale_x_continuous(limits=c(1,5))
p2 = ggplot(iris, aes(Sepal.Width, Petal.Width, colour=Species)) +
my_theme +
labs(x="Sepal Width", y="Petal Width")
# Function to extract legend
# https://github.com/hadley/ggplot2/wiki/Share-a-legend-between-two-ggplot2-graphs
g_legend<-function(a.gplot){
tmp <- ggplot_gtable(ggplot_build(a.gplot))
leg <- which(sapply(tmp$grobs, function(x) x$name) == "guide-box")
legend <- tmp$grobs[[leg]]
return(legend)}
leg = g_legend(p1)
grid.arrange(leg,
arrangeGrob(grobs=lapply(list(p1,p2), function(p) p + guides(colour=FALSE, shape=FALSE)), ncol=2),
ncol=1, heights=c(1,10))