centos 7.3 では、最低限の shapely または geopandas をインストールしようとすると、https: //github.com/libgeos/libgeos libgeos にアクセスする必要があります。
経由でこれをインストールしようとするとsudo yum install libgeos-dev、このパッケージが利用できないことがわかります。リポジトリが不足しているようです。これまでのところ、 http://trac.osgeo.org/geosが RPM のhttps://yum.postgresql.org/repopackages.php#pg96を指しているため、動作するものを見つけることができませんでしたが、それでも rpm -Uvh の後https://download.postgresql.org/pub/repos/yum/9.6/redhat/rhel-7-x86_64/pgdg-centos96-9.6-3.noarch.rpmインストール候補が見つかりません。