これは私の側では一種のクルーゲフェストだと思いますが、初期化によって「自己」が返される前に、多くの重要なパラメーターを設定するルイージおよびシルイジモジュールを使用しています。また、self が返された後にこれらのパラメーターを手動で処理しようとすると、Luigi.Parameter オブジェクトがそれらをマスクして、必要なことを実行できなくなります。
luigi および sciluigi クラス (使用する場合) には no が含まれます__init__
。__init__
または呼び出しを挿入しようとするとsuper(ChildClass, self).__init__(*args, **kwargs)
...奇妙なエラー「予期しないパラメーター」エラーが発生します。
Sciluigi クラスは次のようになります...
class MyTask(sciluigi.task):
param1 = sciluigi.Parameter(default='Yes') #String only
param2 = sciluigi.Parameter(default='No') #String only
def out_target(self):
return sciluigi.TargetInfo(self, self.out)
def run(self):
with self.out_target().open('w') as foofile:
foofile.write('foo\n')
SO ... setattr PRIOR を介していくつかのパラメーターを動的に設定して、実際に「自己」が返されることを望んでいます。ただし、setattr にはオブジェクトが必要です。
私は次のようなことができることを望んでいました...
setattr(inspect.stack()[?][?], 'DynamicVar', sciluigi.Parameter(default='Yes') )
編集:@Charles Duffy
うーん、どの情報が最も役立つかわかりません。
最初の問題は; init を追加できません。__init__
メソッドを追加した実際のコードを以下に示します。実行しようとすると、結果のエラーが含まれています。スーパーコールを実行しようとすると、同じエラーが発生します__init__
class FileConverter(sciluigi.Task):
"""
"""
in_target = None # Mandatory
out = sciluigi.Parameter() # <file>
exepath = sciluigi.Parameter(default = "")
def __init__(self):
self.var = 'anything'
def out_target(self):
log.debug("In 'FileConverter.out_target'... ")
return sciluigi.TargetInfo(self, self.out)
def run(self):
result = None
command = ''.join([
self.exepath, _slash, "FileConverter ",
" -in ", self.in_target().path,
" -out ", self.out_target().path,
" -out_type ", self.file_type
])
log.info("RUNNING COMMAND: " + command)
result = self.ex(command)
log.info("result: " + result[1])
エラー
2017-02-24 17:01:48 | WARNING | Will not run MyWorkflow(instance_name=sciluigi_workflow) or any dependencies due to error in deps() method:
Traceback (most recent call last):
File "/Library/Python/2.7/site-packages/luigi/worker.py", line 697, in _add
deps = task.deps()
File "/Library/Python/2.7/site-packages/luigi/task.py", line 572, in deps
return flatten(self._requires())
File "/Library/Python/2.7/site-packages/luigi/task.py", line 544, in _requires
return flatten(self.requires()) # base impl
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sciluigi/workflow.py", line 105, in requires
workflow_output = self.workflow()
File "/Users/mikes/Documents/Eclipseworkspace/Bioproximity/OpenMS-Python-Luigi/site-packages/Bioproximity/sciluigi_tasks/PipelineTest1.py", line 33, in workflow
exepath = "/Applications/OpenMS-2.1.0/TOPP"
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sciluigi/workflow.py", line 145, in new_task
newtask = sciluigi.new_task(instance_name, cls, self, **kwargs)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sciluigi/task.py", line 37, in new_task
newtask = cls.from_str_params(kwargs)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/luigi/task.py", line 412, in from_str_params
return cls(**kwargs)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/luigi/task_register.py", line 99, in __call__
h[k] = instantiate()
File "/Library/Python/2.7/site-packages/luigi/task_register.py", line 80, in instantiate
return super(Register, cls).__call__(*args, **kwargs)
TypeError: __init__() got an unexpected keyword argument 'instance_name'
2番目の問題は次のとおりです。
自分自身が戻るのを待つと、(たとえば、上記のコードを使用して) 区別できなくなります...
in_target = None # Mandatory
out = sciluigi.Parameter() # <file>
を実行するtype(out)
と、 type はパラメーターが単なる文字列 (sciluigi.Parameter オブジェクトではない) であると報告するため、`ìsinstance(out, sciluigi.Parameter) を使用しようとすると...False が返されます。
要点は次のとおりです。
sciluigi.Parameter オブジェクトを動的に (プログラムで) 設定し、その後 sciluigi.Parameter() オブジェクト変数 ( などout
) と「実際の」 str() オブジェクト ( などin_target
)を区別できるようにする必要があります。
これが理にかなっていることを願っています。