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Linux 環境は初めてで、バイオインフォマティクス パッケージ (vcftools - https://vcftools.github.io/examples.html )をインストールしようとしています。何らかの理由で、Cygwin 環境で問題なくコンパイルできます。他の同僚は問題なくパッケージをインストールしましたが、同じコンピューターの VirtualBox で Ubuntu 環境でコンパイルしようとすると、エラーが発生します (以下のとおり)。次のエラーが表示されます。このエラーを解決する方法について誰か提案がありますか?

$make インストール

出力

Installing VCF tools
make[1]: Entering directory '/home/wde/selt/selectionTools/vcftools_0.1.11/cpp'
g++ -c -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  vcftools.cpp -o vcftools.o
g++ -MM -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  vcftools.cpp > vcftools.d
g++ -c -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  bcf_file.cpp -o bcf_file.o
g++ -MM -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  bcf_file.cpp > bcf_file.d
g++ -c -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  vcf_file.cpp -o vcf_file.o
vcf_file.cpp: In constructor ‘vcf_file::vcf_file()’:
**vcf_file.cpp:25:13: **error: cannot convert ‘bool’** to ‘gzFile {aka gzFile_s*}’ in assignment**
  gzvcf_in = false;
             ^~~~~
Makefile:53: recipe for target 'vcf_file.o' failed
make[1]: *** [vcf_file.o] Error 1
make[1]: Leaving directory '/home/wde/selt/selectionTools/vcftools_0.1.11/cpp'
/bin/sh: 2: cd: can't cd to perl
Makefile:24: recipe for target 'install' failed
make: *** [install] Error 2
error with make
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基本的に、メイクファイルが行うことは、コンパイラへの呼び出しを自動化することです。したがって、makefile からの出力は、コマンド ライン内からソース ファイルをコンパイルする場合に発生する通常のコンパイル エラーに似ています。上記のエラー ログの重要な行は次のとおりです。

vcf_file.cpp: コンストラクター 'vcf_file::vcf_file()':
**vcf_file.cpp:25:13: **エラー: 割り当てで 'bool'** を 'gzFile {aka gzFile_s*}' に変換できません** gzvcf_in = 偽;

gzvcf_inタイプpointer to gzFile_sです。bool 変数をポインター型に割り当ててもコンパイルされません。したがって、エラーメッセージ。内の をポインター リテラルまたはマクロに置き換えてvcf_file.cpp、falsemakefilestd::nullptrをNULL再実行します。

ところで。vcfの github リポジトリにあるvcf_file.cpp ファイルを確認しました。上記のエラーの原因となる行は含まれていません。古い/変更されたバージョンがあり、コンパイラ エラーが発生する可能性があります。

于 2017-02-28T14:41:57.063 に答える