レイアウトオブジェクトは、ブロックオブジェクトのコレクションです。ブロックは親/子ツリー形式で編成されています。
レイアウトには単一のブロックがあります。子ブロックを追加していません。したがって、ブロックのテンプレートがgetChildHtmlを使用して子をレンダリングしようとすると、子を見つけることができず、追加の出力は生成されません。
さらに、topLinksブロックは、デフォルトでは何もレンダリングしません。リンクを追加する必要があります。これは通常、他のlayout.xmlファイルを介して行われます。
最後に、への呼び出しでレンダリングを開始する方がおそらく良いでしょう。
echo $block_header->toHtml();
以下は、ブロックを正しくネストし、アクションメソッドを呼び出して、通常のディスパッチ手順の範囲外でブロックをレンダリングできるようにする方法の例です。新しいリンクブロックを作成し、それにリンクを追加して、トップレベルのブロックに追加するという点で、あなたとは異なります。
require_once 'app/Mage.php';
umask(0);
Mage::app('default');
$layout = Mage::getSingleton('core/layout');
$block_header = $layout->createBlock('page/html_header')->setTemplate('page/html/header.phtml');
// <block type="" name="top.links" as="topLinks"/>
$block_links = $layout->createBlock('page/template_links','top.links')->setTemplate('page/template/links.phtml');
$block_header->setChild('topLinks',$block_links);
//<reference name="top.links">
// <action method="addLink" translate="label title" module="customer"><label>My Account</label><url helper="customer/getAccountUrl"/><title>My Account</title><prepare/><urlParams/><position>10</position></action>
//</reference>
$block_links->addLink('My Account','foo/baz/bar/','My Account','','',10);
echo $block_header->toHtml();