このサイトの大きな助けを借りて、以前にいくつかの Numpy C 拡張を作成しましたが、返されたパラメーターを見る限り、すべて固定長です。
代わりに Numpy C 拡張に可変長の numpy 配列を返す方法はありますか?
このサイトの大きな助けを借りて、以前にいくつかの Numpy C 拡張を作成しましたが、返されたパラメーターを見る限り、すべて固定長です。
代わりに Numpy C 拡張に可変長の numpy 配列を返す方法はありますか?
Numpy C-API を使用して Cython で numpy 拡張機能を作成する方が簡単な場合があります。これにより、python と c オブジェクトを混在させることができるため、プロセスが簡素化されます。その場合、可変長配列を作成することはほとんど難しくなく、任意の形状の配列を指定するだけで済みます。
Cython numpy チュートリアルは、おそらくこのトピックに関する最良の情報源です。
たとえば、これは私が最近書いた関数です。
import numpy as np
cimport numpy as np
cimport cython
dtype = np.double
ctypedef double dtype_t
np.import_ufunc()
np.import_array()
def ewma(a, d, axis):
#Calculates the exponentially weighted moving average of array a along axis using the parameter d.
cdef void *args[1]
cdef double weight[1]
weight[0] = <double>np.exp(-d)
args[0] = &weight[0]
return apply_along_axis(&ewma_func, np.array(a, dtype = float), np.double, np.double, False, &(args[0]), <int>axis)
cdef void ewma_func(int n, void* aData,int astride, void* oData, int ostride, void** args):
#Exponentially weighted moving average calculation function
cdef double avg = 0.0
cdef double weight = (<double*>(args[0]))[0]
cdef int i = 0
for i in range(n):
avg = (<double*>((<char*>aData) + i * astride))[0]*weight + avg * (1.0 - weight)
(<double*>((<char*>oData) + i * ostride))[0] = avg
ctypedef void (*func_1d)(int, void*, int, void*, int, void **)
cdef apply_along_axis(func_1d function, a, adtype, odtype, reduce, void** args, int axis):
#generic function for applying a cython function along a particular dimension
oshape = list(a.shape)
if reduce :
oshape[axis] = 1
out = np.empty(oshape, odtype)
cdef np.flatiter ita, ito
ita = np.PyArray_IterAllButAxis(a, &axis)
ito = np.PyArray_IterAllButAxis(out, &axis)
cdef int axis_length = a.shape[axis]
cdef int a_axis_stride = a.strides[axis]
cdef int o_axis_stride = out.strides[axis]
if reduce:
o_axis_stride = 0
while np.PyArray_ITER_NOTDONE(ita):
function(axis_length, np.PyArray_ITER_DATA (ita), a_axis_stride, np.PyArray_ITER_DATA (ito), o_axis_stride, args)
np.PyArray_ITER_NEXT(ita)
np.PyArray_ITER_NEXT(ito)
if reduce:
oshape.pop(axis)
out.shape = oshape
return out
これが気に入らない場合は、任意の形状の新しい空の配列を作成する関数があります (リンク)。