レポで「git status」を実行すると、次のようになります。
# On branch master
# Changes to be committed:
# (use "git reset HEAD <file>..." to unstage)
#
# modified: myfile
ただし、「git diff myfile」を実行しても違いはありません。これは、変更を加えて削除したため、元に戻ったためですか?
「git checkout myfile」を実行してクリアする必要がありますか?