python - 回転できるPythonで3D散布図をプロットする簡単な方法はありますか？

Question

現在、matplotlibを使用して3D散布図をプロットしていますが、作業が完了している間は、データをよりよく表示するために回転させる方法が見つからないようです。

次に例を示します。

import pylab as p
import mpl_toolkits.mplot3d.axes3d as p3

#data is an ndarray with the necessary data and colors is an ndarray with
#'b', 'g' and 'r' to paint each point according to its class

...

fig=p.figure()
ax = p3.Axes3D(fig)
ax.scatter(data[:,0], data[:,2], data[:,3], c=colors)
ax.set_xlabel('X')
ax.set_ylabel('Y')
ax.set_zlabel('Z')
fig.add_axes(ax)
p.show()

実行時に実行できるソリューションが欲しいのですが、回転できる限り、短くて速いので問題ありません。

PCAをアイリスデータセットに適用した後に生成されたプロットの比較は次のとおり です
。1。mayavi2.matplotlib

Mayaviを使用するとデータの視覚化が容易になりますが、MatPlotLibはよりプロフェッショナルに見えます。Matplotlibも軽量です。

Answer 1

さて、最初に「私のデータをよりよく見る」とはどういう意味かを定義する必要があります...

インタラクティブに作業したい場合は、マウスを使用してプロットを回転および拡大できます。

プログラムで軸を回転させたいだけの場合は、プロットを表示する仰角と方位角（度単位）の ax.view_init(elev, azim)場所elevとを使用します。azim

または、、、、およびプロパティを使用してax.elev、現在の視点の標高、方位角、および距離を取得/設定できます。ax.azimax.dist

この例からソースを借りる：

import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt

def randrange(n, vmin, vmax):
    return (vmax-vmin)*np.random.rand(n) + vmin

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
n = 100
for c, m, zl, zh in [('r', 'o', -50, -25), ('b', '^', -30, -5)]:
    xs = randrange(n, 23, 32)
    ys = randrange(n, 0, 100)
    zs = randrange(n, zl, zh)
    ax.scatter(xs, ys, zs, c=c, marker=m)

ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')

plt.show()

素晴らしい散布図が得られます。

図のように、プログラムで軸を回転させることができます。

import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt

def randrange(n, vmin, vmax):
    return (vmax-vmin)*np.random.rand(n) + vmin

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
n = 100
for c, m, zl, zh in [('r', 'o', -50, -25), ('b', '^', -30, -5)]:
    xs = randrange(n, 23, 32)
    ys = randrange(n, 0, 100)
    zs = randrange(n, zl, zh)
    ax.scatter(xs, ys, zs, c=c, marker=m)

ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')

ax.azim = 200
ax.elev = -45

plt.show()

それが少し役立つことを願っています！

Answer 2

mayaviを使用すると、次のようなプロットを作成できます。

import enthought.mayavi.mlab as mylab
import numpy as np
x, y, z, value = np.random.random((4, 40))
mylab.points3d(x, y, z, value)
mylab.show()

GUIを使用すると、クリックアンドドラッグで回転したり、右クリックアンドドラッグでズームイン/ズームアウトしたりできます。