c++ - gdb での奇妙な動作

Question

コードで非常に奇妙なバグが発生しています。

プログラムで変数を使用してm_requestedStructuresいますが、デバッガーが検査時に間違ったアドレスにアクセスしています。たとえば、コードに次のものがあります。

qDebug() << "requested: " << m_requestedStructures << " " << &m_requestedStructures

ここにブレークポイントを設定します。ブレークポイントに到達したら、出力された値とアドレスm_requestedStructuresを gdb がアクセスしているものと比較します。

requested:  0   0xfce640 
Breakpoint 1
157         qDebug() << "requested: " << m_requestedStructures << " " << &m_requestedStructures;
(gdb) p m_requestedStructures
$5 = -1167616
(gdb) p &m_requestedStructures
$6 = (int *) 0xfce644
(gdb)

ご覧のとおり、値とアドレスの両方が異なります。

私が見ている別の症状は、QueueManager::checkPopulation_()かなり前に削除した関数がありましたが、gdb はまだタブ補完を試みており、それにブレークポイントを設定すると、関数が使用されたポイントで壊れます。することが。

記号が正しく読み取られていないようです。クリーンなディレクトリから再構築しようとしましたが、問題は解決しません。これを引き起こしている原因や修正方法を知っている人はいますか?

前もって感謝します！

編集:追加した新しい関数にブレークポイントを設定しようとしました。関数QueueManager::run()は完全に gdb のタブに表示されますが、ブレークポイントを設定しようとすると、

the class GlobalSearch::QueueManager does not have any method named run

また、ローカル スコープの変数と QueueManager のメンバーの両方の他の変数を調べると、問題なく動作するようです。

コンパイラ/リンカーの出力は次のとおりです。クラスを含むファイルはqueuemanager.cpp、静的ライブラリの一部でありlibglobalsearch.a、動的ライブラリで使用されますxtalopt.so:

$ make VERBOSE=1 xtalopt
/usr/bin/cmake -H/git/xtalopt-public -B/git/xtalopt-public/build --check-build-system CMakeFiles/Makefile.cmake 0
make -f CMakeFiles/Makefile2 xtalopt
make[1]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
/usr/bin/cmake -H/git/xtalopt-public -B/git/xtalopt-public/build --check-build-system CMakeFiles/Makefile.cmake 0
/usr/bin/cmake -E cmake_progress_start /git/xtalopt-public/build/CMakeFiles 63
make -f CMakeFiles/Makefile2 src/xtalopt/CMakeFiles/xtalopt.dir/all
make[2]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
make -f src/spglib/CMakeFiles/spglib.dir/build.make src/spglib/CMakeFiles/spglib.dir/depend
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
cd /git/xtalopt-public/build && /usr/bin/cmake -E cmake_depends "Unix Makefiles" /git/xtalopt-public /git/xtalopt-public/src/spglib /git/xtalopt-public/build /git/xtalopt-public/build/src/spglib /git/xtalopt-public/build/src/spglib/CMakeFiles/spglib.dir/DependInfo.cmake --color=
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
make -f src/spglib/CMakeFiles/spglib.dir/build.make src/spglib/CMakeFiles/spglib.dir/build
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
make[3]: Nothing to be done for `src/spglib/CMakeFiles/spglib.dir/build'.
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
/usr/bin/cmake -E cmake_progress_report /git/xtalopt-public/build/CMakeFiles  18 19 20 21 22 23
[  9%] Built target spglib
make -f src/libssh/CMakeFiles/ssh_static.dir/build.make src/libssh/CMakeFiles/ssh_static.dir/depend
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
cd /git/xtalopt-public/build && /usr/bin/cmake -E cmake_depends "Unix Makefiles" /git/xtalopt-public /git/xtalopt-public/src/libssh /git/xtalopt-public/build /git/xtalopt-public/build/src/libssh /git/xtalopt-public/build/src/libssh/CMakeFiles/ssh_static.dir/DependInfo.cmake --color=
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
make -f src/libssh/CMakeFiles/ssh_static.dir/build.make src/libssh/CMakeFiles/ssh_static.dir/build
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
make[3]: Nothing to be done for `src/libssh/CMakeFiles/ssh_static.dir/build'.
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
/usr/bin/cmake -E cmake_progress_report /git/xtalopt-public/build/CMakeFiles  26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40
[ 33%] Built target ssh_static
make -f src/globalsearch/CMakeFiles/globalsearch.dir/build.make src/globalsearch/CMakeFiles/globalsearch.dir/depend
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
cd /git/xtalopt-public/build && /usr/bin/cmake -E cmake_depends "Unix Makefiles" /git/xtalopt-public /git/xtalopt-public/src/globalsearch /git/xtalopt-public/build /git/xtalopt-public/build/src/globalsearch /git/xtalopt-public/build/src/globalsearch/CMakeFiles/globalsearch.dir/DependInfo.cmake --color=
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
make -f src/globalsearch/CMakeFiles/globalsearch.dir/build.make src/globalsearch/CMakeFiles/globalsearch.dir/build
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
/usr/bin/cmake -E cmake_progress_report /git/xtalopt-public/build/CMakeFiles 
[ 33%] Building CXX object src/globalsearch/CMakeFiles/globalsearch.dir/queuemanager.cpp.o
cd /git/xtalopt-public/build/src/globalsearch && /usr/bin/c++   -DQT_OPENGL_LIB -DQT_GUI_LIB -DQT_CORE_LIB -DQT_PLUGIN -DQT_SHARED -D_HAVE_EXECINFO_H_ -DQT_DEBUG -fPIC -g -I/usr/include/QtOpenGL -I/usr/include/QtGui -I/usr/include/QtCore -I/usr/include/eigen2 -I/git/xtalopt-public/build -I/usr/include/openbabel-2.0 -I/git/xtalopt-public/src   -o CMakeFiles/globalsearch.dir/queuemanager.cpp.o -c /git/xtalopt-public/src/globalsearch/queuemanager.cpp
Linking CXX static library libglobalsearch.a
cd /git/xtalopt-public/build/src/globalsearch && /usr/bin/cmake -P CMakeFiles/globalsearch.dir/cmake_clean_target.cmake
cd /git/xtalopt-public/build/src/globalsearch && /usr/bin/cmake -E cmake_link_script CMakeFiles/globalsearch.dir/link.txt --verbose=1
/usr/bin/ar cr libglobalsearch.a  CMakeFiles/globalsearch.dir/optbase.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/queuemanager.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/structure.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/tracker.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/optimizer.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/bt.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/sshconnection.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/sshmanager.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/random.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/ui/abstractdialog.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/ui/abstracttab.cpp.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_optbase.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_queuemanager.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_structure.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_tracker.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_optimizer.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_bt.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_sshconnection.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_sshmanager.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/moc_random.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/ui/moc_abstractdialog.cxx.o CMakeFiles/globalsearch.dir/ui/moc_abstracttab.cxx.o
/usr/bin/ranlib libglobalsearch.a
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
/usr/bin/cmake -E cmake_progress_report /git/xtalopt-public/build/CMakeFiles  1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
[ 55%] Built target globalsearch
make -f src/xtalopt/CMakeFiles/xtalopt.dir/build.make src/xtalopt/CMakeFiles/xtalopt.dir/depend
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
cd /git/xtalopt-public/build && /usr/bin/cmake -E cmake_depends "Unix Makefiles" /git/xtalopt-public /git/xtalopt-public/src/xtalopt /git/xtalopt-public/build /git/xtalopt-public/build/src/xtalopt /git/xtalopt-public/build/src/xtalopt/CMakeFiles/xtalopt.dir/DependInfo.cmake --color=
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
make -f src/xtalopt/CMakeFiles/xtalopt.dir/build.make src/xtalopt/CMakeFiles/xtalopt.dir/build
make[3]: Entering directory `/git/xtalopt-public/build'
Linking CXX shared library xtalopt.so
cd /git/xtalopt-public/build/src/xtalopt && /usr/bin/cmake -E cmake_link_script CMakeFiles/xtalopt.dir/link.txt --verbose=1
/usr/bin/c++  -fPIC  -fPIC -g  -shared -Wl,-soname,xtalopt.so -o xtalopt.so CMakeFiles/xtalopt.dir/extension.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/xtalopt.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/genetic.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/structures/xtal.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/xtaloptoptimizer.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/vasp.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/gulp.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/pwscf.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/castep.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/testing/xtalopttest.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/dialog.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/tab_init.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/tab_edit.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/tab_opt.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/tab_sys.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/tab_progress.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/tab_plot.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/tab_log.cpp.o CMakeFiles/xtalopt.dir/moc_extension.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/moc_xtalopt.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/moc_genetic.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/structures/moc_xtal.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/moc_xtaloptoptimizer.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/moc_vasp.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/moc_gulp.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/moc_pwscf.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/optimizers/moc_castep.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/testing/moc_xtalopttest.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_dialog.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_tab_init.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_tab_edit.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_tab_opt.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_tab_sys.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_tab_progress.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_tab_plot.cxx.o CMakeFiles/xtalopt.dir/ui/moc_tab_log.cxx.o -lavogadro ../globalsearch/libglobalsearch.a ../spglib/libspglib.a -lQtOpenGL -lGLU -lGL -lSM -lICE -lX11 -lXext -lopenbabel -lQtGui -lQtCore ../libssh/libssh_static.a -lnsl -lresolv -lrt -lz -lssl -lcrypto 
make[3]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
/usr/bin/cmake -E cmake_progress_report /git/xtalopt-public/build/CMakeFiles  45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72
[100%] Built target xtalopt
make[2]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'
/usr/bin/cmake -E cmake_progress_start /git/xtalopt-public/build/CMakeFiles 0
make[1]: Leaving directory `/git/xtalopt-public/build'

Answer 1

私はついにこれを理解することができました！方法は次のとおりです。

gdb では、メモリ内のすべての共有ライブラリをinfo shared. これをテキスト ファイルにコピーしshared.txt、ライブラリ名を次のように抽出しました。

cat shared.txt | grep -v \*|grep -v quit---|grep -v Syms\ Read|grep -v \(gdb\)|awk '{print $4}'>libs

そこから、各ライブラリのシンボルを次のようにチェックしました。

for i in `cat libs|xargs`;do nm --demangle $i|grep checkPopulation; if [ $? -eq 0 ]; then echo \($i\); fi;done

これは、「checkPopulation」を含むすべてのシンボルと、その後にそれぞれを含むライブラリの名前を出力します。私の出力：

000adb18 T GlobalSearch::QueueManager::checkPopulation()
000adb8a T GlobalSearch::QueueManager::checkPopulation_()
(/usr/lib/avogadro/1_1/contrib/randomdock.so)
000db682 T GlobalSearch::QueueManager::checkPopulation()
(/usr/lib/avogadro/1_1/contrib/xtalopt.so)

したがって、この「ファントム」シンボルは、現在削除されている を含むcheckPopulation_古いバージョンの static に対してかなり前に構築された randomdock.so から来ています。randomdock.so を削除すると、すべてが正常に動作します。libglobalsearch.aGlobalSearch::QueueManager::checkPopulation_()

すべての提案に感謝します。これを追跡している間に、確かにいくつかの新しい gdb トリックを学びました。API を壊すことについてのレッスンもここにあります ;-)

Answer 2

参考までに：

grepには-eスイッチがあるため、一度に複数の式を処理できます。例えば：

grep -v -e \* -e quit--- -e Syms\ Read -e \(gdb\) | awk '{print $4}' > libs

nmには-Aスイッチ (出力ファイル名) があります。例えば：

cat libs | xargs nm -A --demangle | grep checkPopulation