以前に使用したことのない Knitr パッケージを使用して、スクリプトの一部をコード チャンクに記述したいという、送信されたマークダウン ファイルに取り組んでいます。
私が直面している問題は、チャンクに配置されたときにスクリプトが機能していないように見えますが、そのコンテキストの外でスクリプトを実行すると問題なく機能することです。
例：
sqlite <- dbDriver("SQLite")
con <- dbConnect(sqlite,"db/sqlite/table.db")
それはうまくいきます。
```{r db_connect}
sqlite <- dbDriver("SQLite")
con <- dbConnect(sqlite,"db/sqlite/table.db")
```
これは動作しません。エラーのトレースバックは次のとおりです。
Error in rsqlite_connect(dbname, loadable.extensions, flags, vfs) : Could
not connect to database: unable to open database file
8. stop(structure(list(message = "Could not connect to database:\nunable to open database file", call = rsqlite_connect(dbname, loadable.extensions, flags, vfs), cppstack = structure(list(file = "", line = -1L, stack = "C++ stack not available on this system"), .Names = c("file", ...
7. rsqlite_connect(dbname, loadable.extensions, flags, vfs)
6. initialize(value, ...)
5. initialize(value, ...)
4. new("SQLiteConnection", ptr = rsqlite_connect(dbname,loadable.extensions, flags, vfs), dbname = dbname, flags = flags, vfs = vfs, loadable.extensions = loadable.extensions, ref = new.env(parent = emptyenv()))
3. .local(drv, ...)
2. dbConnect(sqlite, "db/sqlite/table.db")
1. dbConnect(sqlite, "db/sqlite/table.db")
これをトラブルシューティングする方法に関する推奨事項はありますか?