約 50 個の csv ファイルを読み込んでいます (同じ命名規則、同じ構造、各ファイルは約 150k 行です)。さらに、すべてのファイルをマージしたいのですが、各行の元のソースを識別できるようにしたいと考えています。
これまでの私の解決策は、list.files に基づいてすべてのデータを読み込み、それらを rbindlist および idcol 引数と一緒にマージすることでした。しかし、元のdata.tableの名前を取るようにidcol引数を設定するのに問題があります。さらに、テーブルを rbindlist の有効なリストとして定義するのに苦労しています。
#get filenames + path
temp=list.files(path="C:/LocalData",pattern="RV_*",full.names=TRUE)
#get filenames without path
temp2=list.files(path="C:/LocalData",pattern="RV_*",full.names=FALSE)
# get a substring of names to create a new list for the tbl names
filenames=sapply(temp2,function(x) substr(x,1,5))
#read in all files via fread and store it as an own data.table
for (i in 1:length(temp)) assign(filenames[i], fread(temp[i]))
#now bring all data.tables together and create a new column that indicates the source
RV=rbindlist(as.list(filenames),idcol = TRUE)
Error in rbindlist(as.list(filenames), idcol = TRUE) :
Item 1 of list input is not a data.frame, data.table or list
#if I state the dts individually it works
RV=rbindlist(list(RV_v1,RV_v2,RV_v3,RV_v4,RV_v5),idcol = TRUE)
「filenames」変数に基づいて rbindlist のリストを定義するにはどうすればよいですか?
さらに、新しく作成された id 列に数値のみを含める代わりに、元の data.table の値、たとえば RV_v1 と RV_v2 を取得したいのですが、どうすればそれを達成できますか?
> RV[6:15]
.id Identifier Name Value
1: 1 F AF 68,77523568
2: 1 G AG 30,28675331
3: 2 A AA 71,38992413
4: 2 B AB 86,87556292
5: 2 C AC 60,81629287
6: 2 D AD 5,815721308
7: 2 E AE 11,9030038
8: 2 F AF 56,28142304
9: 2 G AG 3,291405727
10: 3 A AA 59,62673465
>
In R, add NEW column to MULTIPLE df using df namesで同様の質問が既に提起され、回答されています が、私はそれを何らかの方法で変更することができなかったので、それは私にとってはうまくいくでしょう..
私の問題を再現できるようにするために、5 つの csv ファイルのサンプルをアップロードしました。https://www.dropbox.com/s/qst2rgjkb0kpori/RVs.zip?dl=0 よろしくお願いします!
編集:フランクの提案による
rbindlist(lapply(setNames(temp, substr(temp2, 1, 5)), fread), idcol=TRUE)
私がやりたかったことをするのにうまくいきます。どうも!