(注:この質問はBiostarにクロスポストされました)
こんにちは、みんな、
curlを使用して、RPCでエンコードされたSOAPクエリをReactome(生物学的経路データベース)に送信しようとしています。
http://www.reactome.org:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService?wsdlで定義されているリモートメソッドqueryPathwaysForReferenceIdentifiersを呼び出したい
次のSOAP/XMLファイルを作成しました:soap.xml
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<SOAP-ENV:Envelope xmlns:xsi="http://www.w3.org/1999/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/1999/XMLSchema" xmlns:r="http://www.reactome.org:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService" xmlns:SOAP-ENV="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/" xmlns:soapenc="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/" xmlns:reactome="http://www.reactome.org/caBIOWebApp/schema">
<SOAP-ENV:Body>
<r:queryPathwaysForReferenceIdentifiers>
<r:referenceIdentifiers>
<soapenc:Array soapenc:arrayType="soapenc:string[3]">
<soapenc:string>Q9Y266</soapenc:string>
<soapenc:string>P17480</soapenc:string>
<soapenc:string>P2048</soapenc:string>
</soapenc:Array>
</r:referenceIdentifiers>
</r:queryPathwaysForReferenceIdentifiers>
</SOAP-ENV:Body>
</SOAP-ENV:Envelope>
次のコマンドを使用してcurlで送信しました。
curl -d @soap.xml \
-H "Content-Type: application/soap+xml" \
-H 'SOAPAction: ""' \
"http://www.reactome.org:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService"
しかし、応答は空ですが、私は結果を期待していました。
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<soapenv:Envelope xmlns:soapenv="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/" xmlns:xsd="http://www.w3.org/1999/XMLSchema" xmlns:xsi="http://www.w3.org/1999/XMLSchema-instance">
<soapenv:Body>
<ns1:queryPathwaysForReferenceIdentifiersResponse xmlns:ns1="http://www.reactome.org:8080/caBIOWebApp/services/caBIOService" soapenv:encodingStyle="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/">
<queryPathwaysForReferenceIdentifiersReturn xmlns:ns2="http://www.reactome.org/caBIOWebApp/schema" xmlns:soapenc="http://schemas.xmlsoap.org/soap/encoding/" soapenc:arrayType="ns2:Pathway[0]" xsi:type="soapenc:Array"/>
</ns1:queryPathwaysForReferenceIdentifiersResponse>
</soapenv:Body>
</soapenv:Envelope>
リクエストにエラーがありますか?どこ ?
どうもありがとう !
ピエール