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ヒートマップを作成しようとしていますggplot2(以下のコードを参照してください)。変更したいことが 2 つあります。

  1. 私はpValues（うまくいけば非常に小さい）をプロットするので、色の対数スケールをプロットしたい. さまざまなバリエーションで trans="log" を試しましたが、どれも機能しませんでした

  2. 凡例に 6 つ以上の値を表示したい。たとえば、休憩、そのためのラベルを試しましたが、これもうまくいきませんでした

    (p <- ggplot(dataPVal.m, aes(variable, structure)) + 
      geom_tile(aes(fill = pValue), colour = "white") + 
      scale_colour_gradientn(colour = rainbow(100), breaks = c(1,2,3,4,5,6), labels =c("a","b","c","d","e","f")) +
      theme_grey(base_size = base_size) + 
      labs(x = "position (0=seed start)",y = "structure") + ## labels
      #scale_x_discrete(expand = c(0.01, 0.01)) +            ## grauer rand oben/unten
      #scale_y_discrete(expand = c(0.01, 0.01)) +            ## grauer rand links/rechts
      opts(title=plot_title,legend.position = "left",axis.ticks = theme_blank(), axis.text.x = theme_text(size = base_size * 0.8, angle = 330, hjust = 0, colour = "grey50"))
)

pValue テーブル (dataPVal.m) の例を次に示します。

        構造体変数値 pValue
1 CB -10 1.00000000 1.00000000
2 BB -10 1.00000000 1.00000000
3 SC -10 0.34700205 0.34700205
4 GC -10 1.00000000 1.00000000
5 BC -10 1.00000000 1.00000000
6 SG -10 0.44494198 0.44494198
7 JG -10 1.00000000 1.00000000
8 IG -10 1.00000000 1.00000000
9 HG -10 1.00000000 1.00000000
10 CG -10 1.00000000 1.00000000
11 HH -10 1.00000000 1.00000000
12GH -10 0.34375000 0.00000025
13 SI -10 0.25000000 0.25000000
14 JI -10 0.40359735 0.40359735
15 Ⅱ -10 1.00000000 1.00000000
16 GI -10 1.00000000 1.00000000
17 SJ -10 0.53296021 0.53296021
18 IJ -10 1.00000000 1.00000000
19 GJ -10 1.00000000 1.00000000
20 米国 -10 0.19567557 0.19567557
21 SS -10 0.43017585 0.00000032
22 JS -10 1.00000000 1.00000000
23 IS -10 1.00000000 1.00000000
24 GS -10 1.00000000 1.00000000
25 CS -10 1.00000000 1.00000000
26 UU -10 0.39863089 0.39863089
27 SU -10 0.50000000 0.50000000
28 JU -10 1.00000000 1.00000000
29 CB -9 0.34944171 0.34944171
30 BB -9 1.00000000 1.00000000
31 SC -9 0.53230531 0.53230531

この2つの問題の解決策を持っている人はいますか?

thxとても長い

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挿入すると

+ scale_fill_gradient( trans = 'log' ) +

geom_tile(...)塗りつぶしスケールを対数に変更した直後に、 pValue( e^0, e^(-2),...e^(-14)) の 8 つの凡例エントリがあります。それはあなたが試したことですか？

于 2011-02-21T20:24:53.697 に答える