から継承するクラスを作成していete3.Tree
ます。フォーマットされた文字列をオブジェクトに追加したいのですがnewick
、オブジェクトを更新する正しい方法がわかりません。 私はt2
以下を同じ構造にしたいと思います。構造によって、私が行ったようにオブジェクトをt1
構築しますが、空のオブジェクトから構築するのと同じであることを意味します。t2
t1
ete3.Tree
import ete3
newick = "(((petal_width:0.098798,petal_length:0.098798):0.334371,sepal_length:0.433169):1.171322,sepal_width:1.604490);"
t1 = ete3.Tree(newick=newick, name="hello")
t2 = ete3.Tree(name="hello")
t2.add_child(child=ete3.Tree(newick))
print(t1 == t2)
print(t1.__dict__)
print()
print(t2.__dict__)
# False
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514b1c), Tree node 'sepal_width' (0x12aeb4a9)], '_up': None, '_dist': 0.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514ba1)], '_up': None, '_dist': 1.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
これどうやってするの?それらが同じハッシュではないことは理解していますが、_children
属性は 2 つのインスタンス間で異なって見えます。
Python version 3.6.4
ete3 version: 3.1.1