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Python で階層クラスタリング分析を実行しています。私の変数はバイナリなので、バイナリのユークリッド距離を計算する方法を知りたいと思っていました。文献によると、この距離メトリックをこのクラスタリング手法で使用することが可能です。

Choi, SS, Cha, SH, & Tappert, CC (2010). バイナリの類似性と距離測定の調査。ジャーナル オブ システミクス、サイバネティクスおよびインフォマティクス、8(1)、43-48。

使用してscipy.spatial.distance.pdist(X, metric='euclidean')いましたが、この関数は非バイナリ データのユークリッド距離を使用します。

バイナリ ユークリッド距離メトリックに基づいて距離行列を計算する Python ライブラリはありますか?

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