fltk-config スクリプト以外を使用して FLTK プログラムをコンパイルすると問題が発生するようです。
チュートリアルの「Hello world」プログラムからソースをコピーしました。fltk-config --compile hello.cpp を実行すると、出力されます
g++ -I/usr/local/include -I/usr/local/include/FL/images -mwindows -DWIN32 -DUSE_OPENGL32 -D_LARGEFILE_SOURCE -D_LARGEFILE32_SOURCE -o 'hello' 'hello.cpp' -mwindows /usr/local/lib/libfltk.a -lole32 -luuid -lcomct132
そして問題なくコンパイルされます。しかし、同じものを自分で印刷すると、ld.exe は -lcomct132 を見つけることができないと表示されます。
WinXP の MinGW でコンパイルされた FLTK 1.3.0 を使用しています。