コマンドラインからRscript
呼び出すために使用すると、次のエラーが断続的に発生します。mclapply
Error in sendMaster(try(lapply(X = S, FUN = FUN, ...), silent = TRUE)) :
write error, closing pipe to the master
R Studio またはインタラクティブな R セッションからまったく同じコードを実行しても、エラーは発生しません。このエラーは、各ワーカーが非常に大きなオブジェクトを小さなジョブに返さなければならない非常に大きなジョブから、さまざまなコンテキストで発生します。私もprescheduling
オフにしようとしましたが、それでもエラーがスローされます。mc.cores
引数のスレッド数を減らすと、時々それがなくなることがあります。Ubuntu 18.04.1 で Microsoft R Open を使用しています。Ubuntu 16.04 でもポップアップしました。私が試していないことの 1 つは、MRO ではなく標準の R でコードを実行することです。
これが私のものRscript -e 'sessionInfo()'
です:
R version 3.5.1 (2018-07-02)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.1 LTS
Matrix products: default
BLAS: /opt/microsoft/ropen/3.5.1/lib64/R/lib/libRblas.so
LAPACK: /opt/microsoft/ropen/3.5.1/lib64/R/lib/libRlapack.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] RevoUtils_11.0.1 RevoUtilsMath_11.0.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.5.1
何か案は?他の誰かがこのようなことに遭遇しましたか? 再現可能な例がないことをお詫びしますが、これまでにエラーが発生したデータ/コードは共有するには非現実的なほど大きく、他のコンテキストでエラーを再現することはできませんでした。ランダムに発生するだけのようです。