ルートサーバーにRailsアプリケーション（ Redmine ）をインストールしたい。私はすでにさまざまなJavaアプリケーション用にTomcatを実行することを計画しているので、RailsアプリケーションをTomcat6 + JRubyで実行するのが理にかなっているのか、それとも（すでに実行中の）拡張する必要があるのかを自問しています。乗客と一緒にApacheを実行し、Railsアプリを「ネイティブに」実行します。
Java Server + JRubyと比較して、「ネイティブ」RailsサーバーでRailsアプリを実行することには、どのような長所と短所がありますか？
私はJRubyの専門家ではありませんが、最近いくつかの目的で使用しています。JRubyの大きなメリットは、RubyコードでJavaコード（既存のJavaライブラリを含む）を使用できることと、 Rubyを呼び出すおよび/または埋め込むJava。（JRubyの文書化されたサクセスストーリーのほとんどは、RubyからJavaにアクセスする機能に関係しています。）また、MRIを実行するのが困難または不可能なシステムでJRubyを実行することも可能です。
MRIと他のCベースのルビーおよびJRubyの間には、注意が必要ないくつかの違いがあります。それらはJRubyのwikiに文書化されています。
私の意見では（そして他の人は同意しないかもしれませんが）、すでにMRI-rubyベースのサービスなどを実行していて、Java機能にアクセスする必要がない場合は、MRIでRailsアプリを実行します。