R 拡張機能を呼び出して、Linux クラスターで単純な netlogo ビヘイビアスペース実験を実行しています。
サンプルコードは次のとおりです。
extensions [r]
to setup
clear-all
setup-patches
setup-turtles
reset-ticks
end
to setup-patches
ask patches [ set pcolor green ]
end
to setup-turtles
create-turtles number ;; uses the value of the number slider to create turtles
ask turtles [ setxy random-xcor random-ycor ]
end
to go
if ticks >= 5 [ stop ] ;; stop after 5 ticks
move-turtles
tick ;; increase the tick counter by 1 each time through
end
to move-turtles
ask turtles [
right random 360
forward 1
]
end
そして、 count_turtlesという名前の BehaviorSpace 実験をセットアップしました。変数を ["number" 10] として設定します。そして、Linuxで実験を次のように実行します
NetLogo\ 6.0.4/netlogo-headless.sh \
--model model_test.nlogo \
--experiment count_turtles \
--table test.csv
ただし、Linux 上で実行し続けるだけです。しかし、それを切り取った後、適切な test.csv を取得できます。しかし、それだけでは止まりません。
しかし、Windows で同じ実験を実行すると、すべて問題ないように思えます。
そして、r拡張機能の呼び出しを削除すると、適切に停止できます。r 拡張機能を呼び出すと、それ自体は停止しません。しかし、netlogo と R の間の接続をテストしましたが、問題ないようです。なぜそれが自然に止まらないのか疑問に思っています。