パンダ データフレームを介してデータセット内のサイクル (= 各480 値)による欠損データの発生頻度を視覚化するために、24x20 マトリックス (8 つのセクションにそれぞれ 60 セルまたは 6x10 がある) を作成し、各列にプロットしたいと思います。.'A'
'B'
'C'
これまでのところ、csvファイルの作成をマップし、値をマトリックスに正しい方法でマップしsns.heatmap(df.isnull())
、欠落データ(nan & inf)をデータへの影響が最も少ない0
ものに変更した後、プロットすることができました。0.01234
プロットされます。以下はこれまでの私のスクリプトです:
import numpy as np
import pandas as pd
import os
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
def mkdf(ListOf480Numbers):
normalMatrix = np.array_split(ListOf480Numbers,8)
fixMatrix = []
for i in range(8):
lines = np.array_split(normalMatrix[i],6)
newMatrix = [0,0,0,0,0,0]
for j in (1,3,5):
newMatrix[j] = lines[j]
for j in (0,2,4):
newMatrix[j] = lines[j][::-1]
fixMatrix.append(newMatrix)
return fixMatrix
def print_df(fixMatrix):
values = []
for i in range(6):
values.append([*fixMatrix[6][i], *fixMatrix[7][i]])
for i in range(6):
values.append([*fixMatrix[4][i], *fixMatrix[5][i]])
for i in range(6):
values.append([*fixMatrix[2][i], *fixMatrix[3][i]])
for i in range(6):
values.append([*fixMatrix[0][i], *fixMatrix[1][i]])
df = pd.DataFrame(values)
return (df)
dft = pd.read_csv('D:\Feryan.TXT', header=None)
id_set = dft[dft.index % 4 == 0].astype('int').values
A = dft[dft.index % 4 == 1].values
B = dft[dft.index % 4 == 2].values
C = dft[dft.index % 4 == 3].values
data = {'A': A[:,0], 'B': B[:,0], 'C': C[:,0]}
df = pd.DataFrame(data, columns=['A','B','C'], index = id_set[:,0])
nan = np.array(df.isnull())
inf = np.array(df.isnull())
df = df.replace([np.inf, -np.inf], np.nan)
df[np.isinf(df)] = np.nan # convert inf to nan
#dff = df[df.isnull().any(axis=1)] # extract sub data frame
#df = df.fillna(0)
#df = df.replace(0,np.nan)
#next iteration create all plots, change the number of cycles
cycles = int(len(df)/480)
print(cycles)
for cycle in range(3):
count = '{:04}'.format(cycle)
j = cycle * 480
new_value1 = df['A'].iloc[j:j+480]
new_value2 = df['B'].iloc[j:j+480]
new_value3 = df['C'].iloc[j:j+480]
df1 = print_df(mkdf(new_value1))
df2 = print_df(mkdf(new_value2))
df3 = print_df(mkdf(new_value3))
for i in df:
try:
os.mkdir(i)
except:
pass
df1.to_csv(f'{i}/norm{i}{count}.csv', header=None, index=None)
df2.to_csv(f'{i}/norm{i}{count}.csv', header=None, index=None)
df3.to_csv(f'{i}/norm{i}{count}.csv', header=None, index=None)
#plotting all columns ['A','B','C'] in-one-window side by side
fig, ax = plt.subplots(nrows=1, ncols=3 , figsize=(20,10))
plt.subplot(131)
ax = sns.heatmap(df1.isnull(), cbar=False)
ax.axhline(y=6, color='w',linewidth=1.5)
ax.axhline(y=12, color='w',linewidth=1.5)
ax.axhline(y=18, color='w',linewidth=1.5)
ax.axvline(x=10, color='w',linewidth=1.5)
plt.title('Missing-data frequency in A', fontsize=20 , fontweight='bold', color='black', loc='center', style='italic')
plt.axis('off')
plt.subplot(132)
ax = sns.heatmap(df2.isnull(), cbar=False)
ax.axhline(y=6, color='w',linewidth=1.5)
ax.axhline(y=12, color='w',linewidth=1.5)
ax.axhline(y=18, color='w',linewidth=1.5)
ax.axvline(x=10, color='w',linewidth=1.5)
plt.title('Missing-data frequency in B', fontsize=20 , fontweight='bold', color='black', loc='center', style='italic')
plt.axis('off')
plt.subplot(133)
ax = sns.heatmap(df3.isnull(), cbar=False)
ax.axhline(y=6, color='w',linewidth=1.5)
ax.axhline(y=12, color='w',linewidth=1.5)
ax.axhline(y=18, color='w',linewidth=1.5)
ax.axvline(x=10, color='w',linewidth=1.5)
plt.title('Missing-data frequency in C', fontsize=20 , fontweight='bold', color='black', loc='center', style='italic')
plt.axis('off')
plt.suptitle(f'Missing-data visualization', color='yellow', backgroundcolor='black', fontsize=15, fontweight='bold')
plt.subplots_adjust(top=0.92, bottom=0.02, left=0.05, right=0.96, hspace=0.2, wspace=0.2)
fig.text(0.035, 0.93, 'dataset1' , fontsize=19, fontweight='bold', rotation=42., ha='center', va='center',bbox=dict(boxstyle="round",ec=(1., 0.5, 0.5),fc=(1., 0.8, 0.8)))
#fig.tight_layout()
plt.savefig(f'{i}/result{count}.png')
#plt.show()
問題は、どのセクションとセルで頻繁に発生するかを理解するために、欠落データの発生頻度を正しくプロットする方法がわからないことです。
注 1欠損値が多いほど色が明るくなり、サイクル全体の 100% 欠損データは白色で表示され、黒一色は欠損値がないことを示します。黒色の 0% から 100% の白色までの棒グラフが存在する可能性があります。
注 2 3 サイクルのデータセットのサンプル テキスト ファイルも提供します。欠落データはほとんど含まれていませんが、手動で変更して増やすことができます:データセット
期待される結果は次のようになります。