バックグラウンド
ホスト上で実行され、サーバー上でジョブを開始するRスクリプトがあります。ジョブは大きなhdf5ファイルを出力します。
残りの作業はホストで行われます。ただし、R hdf5ライブラリはサーバー上でのみ機能し、ホスト上では機能しません（既知のバグのため）。
ホストのRから、サーバーのRセッションに接続し、R hdf5ライブラリをロードし、hdf5ファイルからデータを抽出して、このオブジェクトをホストに渡すことはできますか？
現在のアプローチ
私の現在の悩みは、サーバー上でRスクリプトを呼び出してRdataファイルへの抽出を行うR内からbashスクリプトを呼び出し、rsyncを使用してそれをホストに戻すことです（すべて内system()）
質問
サーバー上のこれらのhdf5ファイルからデータを抽出するためのより良い方法はありますか？
browserデバッグ時にセッションに入るのと同じように、サーバーのRセッションに入るようなことを考えています。