Git4Ideaプラグインは、新しいIntellij IDEAバージョン8.1で改善されたgitサポートがあっても、インデックスに変更を自動的に追加します。
Jetbrainsフォーラムには、この問題に関する投稿もありますが、返信はありません。
Embracing the Git Indexによると、 Linus Torvaldsはかつて「インデックスを拒否すると、本当にgit自体を拒否する」と言っていました。
Gitを本来の使用方法で使用する場合は、プラグインを無効にして、外部ツールとして、またはコマンドラインからgitを使用するように戻す必要があります。
抽象化されたgitインターフェースの癖にどのように対処していますか?