3D 画像を順番にインポートし、識別ラベルを各フォルダーにリンクしようとしています。現在、dicom ファイルに対してこれを行うコードがありますが、.tiff 画像ファイルも使用しようとしています。
data_dir = "\\tiff\\"
patients = os.listdir(data_dir)
labels_df = pd.read_csv('\\tiff_labels.csv', index_col = 0)
IMG_PX_SIZE = 50
HM_SLICES = 20
def process_data(patient, labels_df, image_px_size = 50, hm_slices = 20, visualize = False):
label = labels_df.at[patient, 'label']
path = data_dir + patient
slices = [pydicom.read_file(path + '/' + s, force = True) for s in os.listdir(path)]
slices.sort(key = lambda x: int(x.ImagePositionPatient[2]))
9 行目と 10 行目を次のように変更してみました。
slices = [cv2.imread(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)]
slices.sort()
私が見つけた問題は 10 行目です: key = lambda x: int(x.ImagePositionPatient[2])。ImagePositionPatient はディコム専用のものであり、別の方法で画像を並べ替える方法を見つけることができません。
エラーが発生します:
Traceback (most recent call last):
File "preprocessing_data.py", line 83, in <module>
image_data, label = process_data(patient, labels_df, image_px_size = IMG_PX_SIZE, hm_slices = HM_SLICES)
File "preprocessing_data.py", line 28, in process_data
slices.sort()
ValueError: The truth value of an array with more than one element is ambiguous. Use a.any() or a.all()