治療のために事後比較を実行しようとしていますが、glht を実行すると、「modelparm.default(model, ...) のエラー: 係数と共分散行列の次元が一致しません」というエラーが発生し続けます。
複数のペアワイズ比較を行うより良い方法はありますか? emmeans も使用してみましたが、それが正しい方法かどうかはわかりません。
これは私のデータのサブセットです:
mydata <- read.table(header=TRUE, text="
treatment total.bites hours rep
A 10 3.1 a1
A 1 3.2 a2
A 1024 3.22 a3
B 0 3.13 a1
B 16 3.15 a2
B 1305 3.24 a3
C 0 3.13 a1
C 0 3.26 a2
C 0 3.11 a3
D 2 3.25 a1
D 0 3.17 a2
D 3 3.21 a3
")
mC4 <- glmmTMB(total.bites~treatment + offset(log(hours)) +(1|rep), ziformula=~0, family=nbinom1, data=mydata)
summary(mC4)
summary(glht(mC4, mcp(treatment = "Tukey")))