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次のような一連の大きなデータフレームがあります。

Year   Variable   Class
1999   0.4504     a
1999   0.4244     a
1999   0.8980     b
1999   0.8901     b
2000   0.2552     a
2000   0.6504     a
2000   0.7830     b
2000   0.2030     b
...    ...        ...
...    ...        ...
2018   0.6520     a
2018   0.1403     a
2018   0.4502     b
2018   0.1240     b

15 の異なるクラスと、各学年とクラスで最低 500 の観測があります。私がやりたいことは、各年とクラスのサブセットを作成し (つまり、20 年 * 15 クラス = 300 サブセット)、QQ プロットを作成してそれらの分布を調べ、それらが正規性とどの程度異なるかを確認することです。

問題は、ループでサブセットを作成できたとしても、プロットを保存して後で見る方法がわからないことです。

アイデアは次のようなものです。

library(data.table)
library(ggpubr)

dataframe_list <- list.files(path="B:/Data/", pattern=".csv", full.names=TRUE)
years <- c(1999:2018)

for (i in 1:13){
  db <- fread(dataframe_list[i])
  for (j in 1:length(years)){
    db_year <- subset(db, db$Year==years[j])
    class <- levels(as.factor(db_year$Class))
    for (k in 1:length(class)){
      db_year_class <- subset(db_year, db_year$Class==class[k])
    } 
  }
}

次を使用して、3 番目のループでプロットを作成します。

ggqqplot(db_year_class$Variable)

ループの最後にそれらすべてがあるまで、何らかの方法で保存します。リストのすべてのデータフレームに対して少なくとも 300 であるため、プロットをデータフレームごとに 1 つのファイルに保存すると便利です。

編集OK、それが私がそれを適応させた方法です：

library(data.table)
library(ggpubr)

dataframe_list <- list.files(path="B:/Data/", pattern=".csv", full.names=TRUE)
df <- c(A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M)
years <- c(1999:2018)
plot_list <- list()

for (i in 1:13){
  db <- fread(dataframe_list[i])
  for (j in 1:length(years)){
    db_year <- subset(db, db$Year==years[j])
    class <- levels(as.factor(db_year$Class))
    for (k in 1:length(class)){
      db_year_class <- subset(db_year, db_year$Class==class[k])
      plot_list[[k]] <- ggqqplot(db_year_class$Variable)+ggtitle(paste0("Code_0_", df[i], "_", years[j], "_", class[k]))
      outfiles <- paste0("B:/Results/Plot/Code_0_", df[i], "_", years[j], ".pdf")
      pdf(file=outfiles, onefile = TRUE)
      for(z in seq_along(list)) {
        print(plot_list[[z]])
      }
      dev.off()
    } 
  }
}

結果は各年の pdf になります。これはあまり便利ではありませんが、それ以外の場合はリスト オブジェクトを使用すると機能しません。リストはループの最後で上書きされます。

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cyl使用するプロトタイプを次に示します。データセット内の値に対して1 つのループを実行しmtcarsただけですが、これをユース ケースに拡張できます。

library(ggplot2)
#container list to hold ggplots
l <- list()

#unique cylinder groups
cyl_groups <- sort(unique(mtcars$cyl))

#iterate through each cylinder group, plotting mpg vs disp
for(j in seq_along(cyl_groups)){
  l[[j]] <- ggplot(mtcars[mtcars$cyl == cyl_groups[[j]], ], aes(mpg, disp)) + geom_point() + ggtitle(paste0("Cylinders = ", cyl_groups[j]))
}

#save into one PDF
pdf("plots.pdf", onefile = TRUE)
for(i in seq_along(l)) {
  print(l[[i]])
}
dev.off()

これにより、各プロットのページを含む PDF が提供されます。

于 2019-04-26T16:54:44.640 に答える