python - PyO3 で Rust から Numpy をロードするときの _ctypes 拡張子の問題

Question

すべてconda環境内で、pyO3を使用してRustからnumpyを使用しようとしています。pyO3 をリンクするために、conda を使用して GCC ツールチェーンもインストールしました。

を表示するなどの簡単なことを実行できるようになりsys.pathました。ただし、numpy をインポートしようとすると、次のようになります。

use pyo3::prelude::*;
use pyo3::types::IntoPyDict;

fn main() -> PyResult<()> {
    let gil = Python::acquire_gil();
    let py = gil.python();

    let r = py.import("numpy");
    match r {
        Ok(_) => println!("OK"),
        Err(e) => e.print(py),
    }

    Ok(())
}

次のことが起こります。

Traceback (most recent call last):
  File "<HOME>/anaconda3/envs/pyrust/lib/python3.7/site-packages/numpy/__init__.py", line 140, in <module>
    from . import _distributor_init
  File "<HOME>/anaconda3/envs/pyrust/lib/python3.7/site-packages/numpy/_distributor_init.py", line 33, in <module>
    with RTLD_for_MKL():
  File "<HOME>/anaconda3/envs/pyrust/lib/python3.7/site-packages/numpy/_distributor_init.py", line 18, in __enter__
    import ctypes
  File "<HOME>/anaconda3/envs/pyrust/lib/python3.7/ctypes/__init__.py", line 7, in <module>
    from _ctypes import Union, Structure, Array
ImportError: <HOME>/anaconda3/envs/pyrust/lib/python3.7/lib-dynload/_ctypes.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so: undefined symbol: PyUnicode_FromFormat

興味深いことに、単にタイプpython -c "import numpy"すると、問題は発生しません。

RUSTFLAGS="-C linker=$CC" cargo +nightly runそれが役立つ場合は、コードをビルドして実行するために使用します。