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2 つの文字列 (DNA シーケンス) を取得して、アライメント スコアを生成したいと考えています。DECIPHER パッケージを見つけましたが、アライメント スコアではなく、アライメントのみを生成できました。「Biostrings」も試してみましたが、スコアを生成できませんでした。

ご協力いただきありがとうございます!

string1 <- "ACAGT"
string2 <- "CCAGTA"

私はこのようなものを探しています

t <- FunctionThatWouldReturnAlignmentScore(string1, string2)
print(t) # this returns 2
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