ソルバーsparse matrix system (Ax = b)
をeigen
使用して非常に大きな問題を解決しようとしています。pardiso
でコードをコンパイルするとg++
、次のエラーが発生します。
In file included from ${Eigenroot}/Eigen/PardisoSupport:31,
from code.cpp:8:
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h: In static member function 'static IndexType Eigen::internal::pardiso_run_selector<IndexType>::run(void*, IndexType, IndexType, IndexType, IndexType, IndexType, void*, IndexType*, IndexType*, IndexType*, IndexType, IndexType*, IndexType, void*, void*) [with IndexType = int]':
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h:269: instantiated from 'Derived& Eigen::PardisoImpl<Derived>::compute(const typename Eigen::internal::pardiso_traits<Derived>::MatrixType&) [with Derived = Eigen::PardisoLU<Eigen::SparseMatrix<double, 0, int> >]'
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h:409: instantiated from 'Eigen::PardisoLU<_MatrixType>::PardisoLU(const MatrixType&) [with MatrixType = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>]'
code.cpp:82: instantiated from here
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h:50: error: cannot convert 'int*' to 'const long long int*' for argument '2' to 'void pardiso(void*, const long long int*, const long long int*, const long long int*, const long long int*, const long long int*, const void*, const long long int*, const long long int*, long long int*, const long long int*, long long int*, const long long int*, void*, void*, long long int*)'
' の形式を変更する必要はないと思っていましたsparse matrices
が、 に収まる疎行列の形式を変更する必要があるようpardiso
です。しかし、他の方のサンプルコードを見つけたところ、sparse matrix
形が変わっていませんでした。そして、それもうまくいくようです。
私はそれを正しく理解していますか?私はちょっと確信が持てません。何が問題なのか誰にも教えてもらえますか?
(A と B については、この問題とは関係ありません。なぜなら、固有値の組み込みソルバーである sparseLU で答えが得られたからです。しかし、速度が遅すぎたため、pardisoLU を使用してみました。)
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <Eigen/Sparse>
#include <unsupported/Eigen/SparseExtra>
#include <Eigen/PardisoSupport>
using namespace std;
using namespace Eigen;
typedef Eigen::Triplet<double> T;
typedef Eigen::SparseMatrix<double> SpMat;
int main(){
int m = 10000; // number of rows;
int n = 10000; // number of cols;
SpMat A(m,n); // declare sparse matrix A
//
make tripletlist
//
A.setFromTriplets(TripletList.begin(), TripletList.end());
SpMat B(m,1);
//
insert values into B
//
PardisoLU< SparseMatrix<double> > solver( A );
x = solver.solve( B );
}
そして、これを次のようにコンパイルしg++
ます
g++ -I ${Eigenroot} -DEIGEN_USE_MKL_ALL -DMKL_ILP64 -m64 -I ${mklroot}/linux/mkl/include -o out.out code.cpp -L ${mklroot}/linux/mkl/lib/intel64 -Wl, -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_gnu_thread -lmkl_core -lmkl_blacs_intelmpi_ilp64 -lgomp -lpthread -lm -ldl