数値の遺伝子型コードを DNA 文字に置き換えるにはどうすればよいですか? 次のような変更された vcf ファイルがあります。
POS REF ALT A2.bam C10.bam
448 T C 0/0:0,255,255 0/0:0,255,255
2402 C T 1/1:209,23,0 xxx:255,0,255
n...
0/0 を ref 文字に、1/1 を alt 文字に置き換え、その後のすべての文字列を削除したいと考えています。次のようになります。
POS REF ALT A2.bam C10.bam
448 T C T T
2402 C G G xxx
n...
sedでそれをやろうとしていたが、うまくいかなかった アプローチする方法がわからない