Project Navigator では、プロジェクト ファイルの横に小さな "M" が表示され、変更されていることを意味します。そこで、バージョン エディタをタップします。左側にはプロジェクト ファイルの内容が表示され、右側には「No Editor」と表示されます。ソース管理に行って、選択したファイルをコミットしても同じことです...
ただし、他のファイル (.m、.h、.plist など) はすべて実際の違いを示し、変更を正しくチェックインします。
どういうわけかこれを誤って構成していますか?