私のデータは、次の形式の 10GB ファイルです。
[ 1234567890 ][ 2020052701020201 ][ value1 ][ value2 ][ key3 = value3 ]...[ keyn = valuen ]
ノート:
- [ key = value ] ブロックはいくつあってもかまいません。
- chars
[
であり]
、値自体に含まれています。たとえば、次のようになります。[ hello = wo[rld] ]
- スクリプトで変更/処理できることを除いて、abinputファイルを制御することはできません。
- いくつかの列だけが必要ですが、それらには文字
[
と]
値が含まれています。
私の単純なfor line in f:
関数では、' ][ '
パターンで分割できます。ただし、ファイルのサイズを考えると、dask は非常に有利です。
engine='c'
with i で複数文字のセパレータを使用できないことはわかっていますが、に切り替えるとengine='python'
予測できない結果が生じます。以下に例を示します。
def init_ddf(filename):
return ddf.read_csv(
filename,
blocksize="1GB",
sep="]",
usecols=[1, 8],
na_filter=False,
names=["hello", World" ],
engine="c",
)
上記のコードは、予想どおりParserError: Too many columns specified: expected 25 and found 24
. このエラーは、特定するのが難しい特定の行が原因で発生するため、再現が非常に困難です。列が増えるたびに発生するわけではありません。したがって、上記の関数で次のように変更しました:engine="python"
とsep=" \]\[ "
. これは、私がテストした小さなサンプルデータで機能します。しかし、10G ファイルでは、次の予測できない動作が発生します。
def init_pyddf(filename, usecols, names):
return ddf.read_csv(
filename,
blocksize="1GB",
sep=" \]\[ ",
usecols=usecols,
na_filter=False,
names=names,
engine="python",
)
In [50]: !head /tmp/foo /tmp/bar
==> /tmp/foo <==
[ 1234567890 ][ 2020052701020201 ][ value1 ][ value2 ][ key3 = value3 ][ keyn = valuen ]
[ 1590471107 ][ 20200526T0731460 ][ THEOQQ ][ e = CL ][ Even = 175134 ][ rded = a12344 ][ blah = INVALID ][ N = T ][ ED = 13606 ]
==> /tmp/bar <==
[ 1234567890 ][ 2020052701020201 ][ value1 ][ value2 ][ key3 = value3 ][ keyn = valuen ]
[ 1590471107 ][ 20200526T0731460 ][ THEOQQ ][ e = CL ][ Even = 175134 ][ rded = a12344 ]
In [51]: init_pyddf("/tmp/foo", [1,2], ["time", "name"]).compute()
Out[51]:
time name
[ 1234567890 2020052701020201 value1 key3 = value3 keyn = valuen ]
[ 1590471107 20200526T0731460 THEOQQ Even = 175134 rded = a12344
In [52]: init_pyddf("/tmp/bar", [1,2], ["time", "name"]).compute()
Out[52]:
time name
0 2020052701020201 value1
1 20200526T0731460 THEOQQ
いくつかの例:
In [110]: !cat /tmp/dummy
[ 0 ][ 000000000000000000000000000 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ]
[ 1 ][ 20200526T073146.901861+0200 ][ T ][ E ][ E ][ F ][ W ][ N ][ E ][ E ][ 5 ]
In [111]: init_pyddf("/tmp/dummy", [1,7], ["time", "name"]).compute().head()
Out[111]:
time name
[ 0 0 0
[ 1 T E
In [112]: !cat /tmp/dummy
[ 0 ][ 000000000000000000000000000 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ]
[ 1 ][ 20200526T073146.901861+0200 ][ T ][ E ][ E ][ F ][ W ][ N ][ E ][ E ]
In [113]: init_pyddf("/tmp/dummy", [1,7], ["time", "name"]).compute().head()
Out[113]:
time name
0 000000000000000000000000000 0
1 20200526T073146.901861+0200 N
In [119]: !cat /tmp/dummy
[ 0 ][ 000000000000000 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ][ 0 ]
[ 1 ][ 20200526T073146 ][ T ][ D ][ F ][ W ][ e ][ E ][ E ][ I ][ T ][ T ][ S ][ S ][ B ][ A ][ E ][ F ][ S ][ P][ T = Y ][ 0 ]
In [120]: init_pyddf("/tmp/dummy", [1,7], ["time", "name"]).compute()
Out[120]:
time name
[ 0 000000000000000 0 0 0 0 0 0 0 0 ] NaN None None
[ 1 20200526T073146 T D F W e E E I T S S