「ハードウェア リアルタイム クロック (RTC) のカーネル同期を有効にする」必要がある rtcsync フラグを使用して Chrony を構成しましたが、そうではありません。
Chrony は ntp を使用してシステム時刻を正しく設定しますが、RTC は変更されておらず、その理由がわかりません。私の推測では、RTC を同期するという Chrony の要求をカーネルが認識していないと思われますが、それは単なる推測です。
バージョン
カーネル: 4.19
Chrony: 3.5
アップデート：
カーネルがアクセスを試みた後に外部 RTC が登録されているように見えます。これにより、RTC と NTP 同期システム時刻との同期が妨げられます。からdmesg:
...
[ 6.317060] hctosys: unable to open rtc device (rtc)
...
[ 14.303503] rtc-ds1307 9-0068: registered as rtc0
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hwclock を 10 分ごとに更新する cronjob を追加して、一時的な回避策を実行しました。